本发明涉及一种基于全息术的图像分区加密系统及方法。所述系统包括激光器，第一、第二和第三反射镜，扩束准直系统，分束器，二分之一波片，四分之一波片，空间光调制器，第一和第二随机相位板，高速图像采集设备，计算机。本发明利用孔径扫描将待加密明文信息分割为若干个子区域的物信息，不同子区域的物信息经随机相位调制后的光束作为物光。引入随机相位调制的参考光与经过每个子区域物信息调制的光波进行干涉生成一系列加密的子全息图，实现明文信息的加密工作；再利用数字处理的办法对每个加密后的子全息图进行解密，分别获得各子区域的明文信息，将若干子区域叠加合成恢复出整幅明文信息。本发明所述方法可以大大提高加密信息的保密程度。