本发明公开了一种缺氧‑好氧移动床生物膜反应系统处理高氨氮废水的启动方法，属废水处理领域，包括：采用污水处理厂二沉池污泥作为接种污泥分别接种于两个装有悬浮生物填料的A、OMBBR反应器中，闷曝，连接成A/O MBBR系统后，以连续流进水方式泵入已稀释的高氨氮废水原水，通过不断进水在驯化污泥的同时排出系统中的污泥，待出水水质稳定后，逐步减小原水的稀释比，提高进水负荷完成启动。该方法能够实现A/O MBBR系统在处理高氨氮废水时快速，高效，稳定的启动，并且能在一定程度上实现污泥减量化，节约污泥处理成本。