本发明属于医用材料技术领域，公开了一种三维可控结构的多层功能性支架的制备方法及应用，该方法包括以下步骤：将医用级左旋聚乳酸粒料与聚环氧乙烷粒料置于烘箱中烘干水分，然后置于单螺杆挤出机中进行熔融共混，挤出料条；将料条利用三辊压光机进行无拉伸冷却，然后剪切成长度为40~60cm的料条，得到具有交替多层同心圆柱结构的聚乳酸/聚环氧乙烷挤出物；将聚乳酸/聚环氧乙烷挤出物再次剪切成长度为5~20mm的料条，经热压工艺、打孔工艺或缠绕工艺得到支架预制品；将支架预制品放置于去离子水中去除聚环氧乙烷层，沥滤，得到三维结构可控的多层功能性支架。该方法工艺简单，适用性广，成本低廉，环境友好，生产效率高，支架应用范围广。