本发明公开了一种疏水性丙烯酸酯共聚物的合成方法，使用少量的复配乳化剂和助稳定剂使丙烯酸酯单体形成均匀稳定的细乳液。采用细乳液聚合方法获得了丙烯酸酯共聚物乳液，在聚合结束后，通过破乳凝聚和多次溶解‑沉淀循环操作的分离工艺，获得疏水性丙烯酸酯共聚物。本发明所获得的共聚物中无明显乳化剂残留，提高了疏水性丙烯酸酯共聚物的纯度和疏水性能，减少了含氟单体的使用量，降低了成本；同时细乳液聚合的聚合场所为油性单体液滴，避免了在常规乳液聚合中丙烯酸酯单体需要经水相扩散至增溶胶束，有效提高了疏水性含氟丙烯酸酯单体的聚合转化率，减小了含氟单体的排放量，降低了环境污染。本发明在防水防污涂料领域有良好的应用前景。