本发明提供了一种航天器用热控多层打孔器，其特征在于，包括手柄、螺杆、蝶形螺母、柱形底座、针头、刻度尺；螺杆的一端被手柄包裹，螺杆的另一端设置有中心镂空区域，螺杆的另一端表面设置有螺纹，针头插入所述中心镂空区域，蝶形螺母、柱形底座通过所述螺纹与螺杆紧固连接，所述螺纹上设置有刻度尺。本发明轻便易于把持，结构简单，操作方便，易于推广；螺杆头部镂空，实现可更换针头设计，便于维护保养；针头为不锈钢材料，高强度耐腐蚀；针头的针眼具备多种规格，可打任意孔径；螺杆螺纹选用细牙螺纹，具有自锁特性，针眼深度可调；柱形底座为黄铜材料且底面积大，满足分散压力的要求并且底面受力均匀，打孔时具有自找垂直能力。