采用铁基纳米晶吸收剂的电磁波吸波结构制备方法，涉及电磁波吸收材料技术。本发明包括下述步骤：1)热处理Fe基纳米晶吸波材料，热处理温度T1，得到第一Fe基纳米晶吸波材料；2)热处理Fe基纳米晶吸波材料，热处理温度T2，得到第二Fe基纳米晶吸波材料；3)在金属基板的上表面设置第一Fe基纳米晶吸波材料，形成第一吸波层；4)在第一吸波层上表面设置第二Fe基纳米晶吸波材料，形成第二吸波层；所述Fe基纳米晶吸波材料成分为Fe(70～90)‑Si(0～15)‑(X)(0～13)‑(Me)(0～5)‑Cu(0～2),下标系数表示原子百分比，X代表元素B或C或P；Me代表Zr或Hf或Ti或Al或Nb；采用本发明技术的吸波材料能够在1‑10GHz频段内比单层吸收结构具有更好的吸收性能。