本发明涉及一种提高毕赤酵母过氧化氢酶表达量的方法，包括以下步骤：S1、提供毕赤酵母菌种子液、基础盐培养基以及发酵罐；S2、将所述基础盐培养基配入至所述发酵罐中，再对所述发酵罐进行预处理和参数设置；S3、将所述种子液接入至位于所述发酵罐内的基础盐培养基中进行流加发酵，在所述流加发酵过程中，待所述基础盐培养基中的甘油消耗完后，继续加入甘油进行发酵培养；S4、待步骤S3中添加的甘油消耗完后，添加甲醇和培养基继续进行流加发酵。该方法通过优化毕赤酵母的发酵工艺，能明显提高过氧化氢酶的表达量和酶活性。