本发明公开了一种卧式高压加热器运行效率实时控制系统及方法，通过在卧式高压加热器的相应管道上安装流量测量装置、压力测量装置、温度测量装置和阀门，以及数据采集与控制系统，来获取相应的流量、压力和温度，以此来计算出卧式高压加热器换热效率，并通过控制阀门开度以调节液位来不断调节卧式高压加热器换热效率以获取合适的换热效率并实现卧式高压加热器运行效率控制。本发明能够实时调整、控制卧式高压加热器效率，有助于及时调整卧式高压加热器运行状态，对节能降耗、增效创收具有显著作用。