一种基于并行SPI总线的行列矩阵式波控系统数据传输方法，使用n通道并行SPI总线和分时m组工作模式，其中m路时钟信号为分组信号，n通道数据通过m组分组信号，经分时操作控制相控阵天线子阵m×n路射频通道的移相器和(或)衰减器，使用k路锁存信号进行区域锁存控制，每次锁存m×n路控制数据，k路锁存可完成共(m×n)×k路相控阵阵元射频通道控制数据的锁存，实现利用较少控制信号对大规模阵元相控阵的控制。本发明方法可有效的控制相控阵天线TR组件的数据更新，且具有最优的更新时间/资源占用比率，可很好的适应从需要高数据刷新率的超高速切换型相控阵天线到以低资源利用率为主要目的的通信慢扫描相控阵天线的应用。