本发明公开了一种基于统计生成模型的医药云平台大数据异常在线预警方法，本发明通过两步过滤方法，包括仿射变换和方向平滑过滤实现对时序片段数据的过滤，从而去除时序片段数据中的相似点，保留少量特征点，从而减小分析数据量，同时为统计生成模型提供数据基础。对于异常预警样本的搜索，本方法采用一种在线混合高斯统计生成模型，该模型拟合了医药数据全生命周期的概率分布，能够对实时时序样本计算其出现概率，并选择其中的低概率序列作为预警样本，实现医药云平台大数据异常在线预警。