本发明公开了一种水下悬浮隧道的浮重比调节系统，包括隧道管节内浮重比调节系统和接岸结构内浮重比调节系统。隧道管节内浮重比调节系统布置在每段管节的给排水室内并包括设在每段管节的给排水室内的排水装置、给水装置和水位监测仪；排水装置包括一组排水管道与潜水泵；给水装置包括一组给水管道；接岸结构浮重比调节系统布置在水泵房内,该水泵房横向设在接岸结构内的管节对接段的一侧，该水泵房与伸到接岸结构内的接岸段管节的给排水室之间通过输水廊道连通；该水泵房自下向上分为蓄水室、输水廊道室、供水阀室和动力与监控室。本发明的浮重比调节系统，能用于隧道营运期隧道管节的超载处理、拉索更换、渗漏修补等工况下的浮重比调节。