本发明公开了一种电子式互感器误差测量装置及方法，包括：同步光电时钟源在上位机发送测试指令时，向待测电子式互感器的合并单元和数据采集模块发送秒脉冲信号；在线监测模块接收所述待测电子式互感器的合并单元在接收到所述秒脉冲信号后发送的网络报文数据帧，并对所述网络报文数据帧进行解析，以获取所述待测电子式互感器的被测电能采样数据；数据采集模块在接收到所述秒脉冲信号后采集标准电子式互感器的电能数据，以获取基准电能采样数据；误差计算模块分别对所述被测电能采样数据和基准电能采样数据进行非同步测量处理，并根据经过非同步测量处理的被测电能采样数据和经过非同步测量处理的基准电能采样数据计算待测电子式互感器的误差。