一种高精度实时飞行导航计算方法，利用高速处理器，在接收到INS导航数据和GNSS信息后，依次执行SINS导航计算、惯导外推以及SINS导航计算、组合导航卡尔曼滤波。在本发明工作的典型工作场景中，SINS导航解算0.5ms，GNSS对SINS导航外推用时小于0.01ms，可忽略，组合导航卡尔曼滤波1.6ms，由于两次导航解算输入不同，需独立运行。因此，共耗时约0.5*2+1.6＝2.6ms，考虑80％时间余量，可满足组合导航计算周期大于3.25ms的系统实时性能要求。本发明充分利用双CPU资源，可实现严苛的实时导航计算性能要求，能够实现精确组合导航。