本发明涉及重防腐涂料领域，尤其涉及一种含水性改性氯醚乳液的水性重防腐涂料及其制备方法。按重量百分比计，其原料包括：A组分：水性改性氯醚乳液52‑59％，超细硫酸钡4‑8％，云母粉3‑6％，磷酸锌2‑6％，正磷酸铝锌1‑3％，增稠剂0.1‑0.5％，润湿剂0.1‑0.2％，消泡剂0.3‑0.5％，分散剂0.1‑0.4％，防闪锈剂0.01‑0.05％，防沉剂0.05‑0.1％，流平剂0.05‑0.1％，成膜助剂1‑5％，填料4‑8％，硅微粉1‑3％；水补充余量；B组分：固化剂50％，水50％；A组分与B组分的重量比为1:(1‑1.5)。本发明制备得到了一种含水性改性氯醚乳液的水性重防腐涂料，制得的水性重防腐涂料柔韧性、抗冲击性优异，在常温下即可快速固化，与基材的附着力强，能够保持持久的耐盐雾保护作用，具有广阔的应用前景。