本发明提供一种吴茱萸药材育苗装置，包括育苗装置本体，所述育苗装置本体包括箱体，所述箱体的一侧固定有水箱和水泵箱，所述水箱上安装有固定板，所述水箱的一侧安装有排污管，所述水泵箱安装在水箱的底部，所述水泵箱与水箱之间安装有进水管和排水管。该吴茱萸药材育苗方法及育苗装置通过电机上的齿轮与齿牙杆相配合同时推动活动箱与固定箱接触，将水通过连接软管进入到活动箱的内部，水位达到活动箱的三分之一，在后期灌溉使用时可再持续进水使用，固定箱内部的土壤通过漏水孔快速对水进行吸附，从而保证土壤的湿润，在使用完成后活动箱与固定箱分离，通过漏水孔将多余的水快速排出，避免水在固定箱内部堆积对幼苗造成的损坏。