一种多层花粉采集箱，本发明涉及花粉采集技术领域；隔板固定设置在处理箱的内底部；枝叶处理机构设置在隔板上侧的处理箱的内部；鼓风机为四个，且分别固定嵌设在风干箱的四周壁上；加热管为数个，且均固定设置在风干箱的内侧壁上；温度传感器固定设置在风干箱的内侧壁上；调节板为两个，且分别通过合页旋转设置在风干箱内侧壁的左右两侧；二号电动推杆为两个，且分别通过铰接件活动设置在调节板的底面上，二号电动推杆的另一端与风干箱内部的左右两侧壁相铰接；均匀铺平机构为两个，且分别设置在风干箱的左右两侧；能够对花粉进行分层处理，且能够对花粉内部的枝叶进行自动化分筛处理，提高了花粉处理的效率。