本发明涉及一种硝化菌剂的制备方法，包括：（1）将硝化细菌悬液调控至含水率高于80%，制备成硝化细菌菌液A，添加海藻酸钠，曝气条件下进行反应；（2）将反应产物脱水至含水率60%‑80%，制备成硝化细菌菌液B，添加糖酯类物质，混匀并进行氮气吹扫；（3）将产物与用聚乙烯亚胺改性的活性炭混匀，并脱水至含水率低于30%，制得硝化菌剂。本发明所制备硝化菌剂抗氧化酶活性稳定、抗氧化性强，在室温有氧条件下能够长期保藏，保藏后菌体活性恢复率较高，氨氮去除效果好。