本发明公开了一种稀土基配合物海洋防污剂及其制备方法，其有效成分的结构式包括#imgabs0#其中，R为H、烷基、杂环基或巯基，Re选自镧、铈、镨、钕、钷、钐、铕、钆、铽、镝、钬、铒、铥、镱、镥、钇和钪稀土元素。本发明由吡啶硫酮钠、酸性α‑氨基酸与可溶性稀土盐三元通过配位构成，降低海洋生物对防污剂的排斥性，使得抗菌防污效果明显，又增加防污剂渗透性，更好渗入细胞内，与细胞内结构结合，从而有效抑制细菌的新陈代谢，具有抗菌广谱、抗菌能力强、抗菌效力持久和生态安全风险低等优点。