本发明公开了一种具有智能防护结构的脉冲发生器及其防护方法，包括脉冲发生器主体、保护机构；脉冲发生器主体上开凿有开关槽和控制面板容纳腔，开关槽内安装有开关，控制面板容纳腔内安装有控制面板，脉冲发生器主体内控制面板容纳腔的底壁上开凿有凹槽；保护机构安装在脉冲发生器主体上，用于防护控制面板，保护机构包括卷帘板，卷帘板滑动设于控制面板容纳腔内，卷帘板的下端连接有配重板。本发明通过相应机构的设置，可以对脉冲发生器凸出按钮与显示器进行防护，避免凸出按钮与显示器在运输过程中的误触或磨损，不仅方便用户对脉冲发生器的再次使用，也可以大大降低用户对脉冲发生器的维护成本，保证用户的使用体验。