本发明提出一种多频多负载无线电能传输系统及其电流跟踪PWM控制方法，该方法在多频多负载无线电能传输系统的原边设置电流采集电路以采集高频逆变器的输出电流，设置电流跟踪PWM控制电路用于基于预先设置的指令电流对高频逆变器的输出电流进行电流跟踪PWM控制。利用系统输出功率大小与指令电流幅值大小之间的关系，对指令电流进行设计，对指令电流的幅值进行设置即可控制负载侧的功率，进而与不同负载的功率需求进行匹配。指令电流的各个频率分量之间可单独设置幅值大小，实现不同频率负载间的独立控制。而指令电流中频率可根据实际应用需求调整，则可适配不同工作频率负载供电需求。