本发明涉及一种基于Internet网络实现的FIDO2认证系统及方法。系统包括用于FIDO认证的移动端APP(即FIDO认证器)、用于FIDO认证请求转发的PC端驱动程序(驱动)、以及用于移动端APP与PC端驱动程序通信的消息服务。方法包括步骤：驱动程序初始化，通过调用keychain或可信平台模块（Trusted Platform Module，TPM）分别生成公钥1和私钥1，并向后端消息服务申请一个消息ID1并基于WebSocket进行通信连接等。本发明基于Internet实现的FIDO2认证方式适用于各种设备、无需额外硬件支持、支持远程登录。此外，两端通信加密实现了高级别安全性，且建立认证耗费时间短，操作起来更加方便快捷，提高了认证效率。