本发明公开一种镜头组装系统包含组装机构、转盘组件、至少一视觉组件、处理模块及通电机构。组装机构移动于通电工位及组装工位。转盘组件具有承载座，用以转动承载座至通电工位。至少一视觉组件用以在通电工位获得第一影像，并在组装工位获得第二影像。处理模块用以依据第一影像获得第一驱动讯号、驱动位置及光圈圆心，并依据第二影像获得第二驱动讯号及镜头圆心。通电机构位于通电工位，用以依据第一驱动讯号及驱动位置产生通电运动。通电运动结束后，组装机构用以依据第二驱动讯产生组装运动，在组装工位将光圈圆心与镜头圆心重合。