本发明公开一种无损可编程的任意矢量光束生成系统及方法，系统包括激光器，激光器的输出激光依次经过偏振片、第一半波片、偏振分束器、酉变换空间光转换系统、偏振合束器、四分之一波片、偏振分析仪和CCD相机，所述偏振分束器与酉变换空间光转换系统之间还设置有第二半波片，酉变换空间光转换系统与偏振合束器之间还设置有第三半波片；所述酉变换空间光转换系统由若干相位平面与平面反射镜组成，酉变换空间光转换系统用于将偏振分束器输出的正交偏振的普通高斯模式激光转换成正交偏振的拉盖尔高斯模式激光；所述相位平面与计算机连接，每个相位平面上显示着通过计算机运行的算法生成的相位掩模。