本发明公开了一种荔枝霜疫霉菌抗病基因LcCLP1及编码蛋白和应用，涉及生物工程技术领域，其技术方案要点是：选择对霜疫霉菌稳定感病的荔枝品种和对抗病的荔枝品种的果实作为样品；将霜疫霉菌侵染后不同时间点的样品，利用转录组测序分析，获得一批差异表达基因；在从步骤S2中获得的所述差异表达基因中获得一个抗病相关基因CLP；基于转录组数据，克隆该基因序列全长；利用qRT‑PCR验证LcCLP1基因的相对表达水平。该基因具有广谱抗性，如果利用抗病资源的创制，可以达到一个基因的超表达可以对2种病原菌(荔枝炭疽菌和霜疫霉菌)防御的效果；该基因具有广谱抗性，在分子标记辅助育种中，早期选择抗病资源时，可以减少50％的工作量。