本发明公开了一种沉管隧道接头柔性排水装置，包括两组防水钢板、柔性水槽及保护壳。两组防水钢板分别安装于管节接缝两侧的管节墙体上，柔性水槽包括槽体及槽体两侧折弯的安装部，两个安装部分别安装于两组防水钢板上，槽体的槽壁上设有朝靠近槽底方向弯曲延伸的挡水板。保护壳覆盖于柔性水槽的外侧。本发明还提供了一种上述沉管隧道接头柔性排水装置的施工方法。上述沉管隧道接头柔性排水装置及其施工方法，柔性水槽可以变形，以适应相邻管节在外荷载作用下发生相对位移，避免管节接缝处漏水，挡水板可以降低水流对柔性水槽的冲刷，避免柔性水槽由于长期冲刷损坏，提高柔性水槽的寿命。