本申请提供了一种试车台在线自动转注过冷控制系统及控制方法，转注过冷控制系统包括第一推进剂贮罐、第二推进剂贮罐、过冷器、液氮供应装置、配气装置、增压控制装置和过冷控制装置；第一或第二推进剂贮罐用于提供推进剂介质，过冷器用于对推进剂介质进行过冷，过冷介质转注至第二或第一推进剂贮罐中，利用第二或第一推进剂贮罐进行试车试验；液氮供应装置用于为过冷器提供冷却介质液氮；增压控制装置用于控制配气装置为第一或第二推进剂贮罐进行气体增压；过冷控制装置用于控制液氮供应装置中的液氮进入过冷器中，以使流入过冷器中的推进剂介质在过冷器中与液氮进行换热。本申请能够确保试验的准时率，节约成本。