本发明公开了一种机载卫星导航通讯系统，涉及导航通讯系统技术领域，卫星导航模块接收卫星数据，声呐模块在潜水艇行驶过程中，获取潜水艇航行方向的多源数据，当潜水艇在浅海航行时，浅海分析模块将卫星数据以及声呐数据综合分析后判断是否需要调节潜水艇下潜，当潜水艇在深海航行时，深海分析模块将健康数据以及声呐数据综合分析后判断是否需要调节潜水艇上浮，在接收到下潜信号或上浮信号时，通讯显示模块将下潜距离或上浮距离反馈给操作人员，该导航通讯系统能够在潜水艇位于浅海或深海航行时，实时判断是否需要调节潜水艇下潜或上浮来避免安全事故的发生，大大保障了潜水艇航行的安全性。