本发明公开了一种考虑发电企业发电指标的电力系统优化方法，包括以下步骤：获取燃煤发电企业历史发电信息，建立燃煤发电企业基准电价多目标优化模型；构建燃煤发电企业电力市场申报模型，与燃煤发电企业基准电价多目标优化模型形成多目标双层优化模型；将多目标双层优化模型转化为单目标双层优化模型进行求解；根据求解结果进行电力系统优化；本发明通过建立多目标双层优化模型，综合考虑碳排放和企业发电量的影响因素，既能保障缺电量的条件风险价值最小，又能保障足够的发电量，使得电力系统稳定运行，提高电力系统的稳定性。