本发明公开了一种含水合物沉积物气‑水相对渗透率升尺度建模方法及系统，涉及天然气水合物资源开采领域，含水合物沉积物气‑水相对渗透率升尺度建模方法，其步骤主要包括：根据所述三维数字岩心图片，得到细孔区域、中孔区域和粗孔区域的表征区域及其孔隙度；利用孔隙网络图像处理分析工具和多孔介质孔隙网络模型，得到各表征区域的绝对渗透率、毛细管压力和气‑水相对渗透率；构建等效含水合物沉积物岩心模型，开展岩心尺度单相流体流动模拟和气‑水两相流动模拟，得到等效含水合物沉积物岩心模型的绝对渗透率和气‑水相对渗透率。实施本发明提供的方法及系统，能实现含水合物沉积物岩心尺度气‑水相对渗透率的有效预测。