本发明提出了一种多重屏障的药物逐级释放制剂及其制备方法，属于缓释药物制剂技术领域。包括装载药物的纳微米球和装载药物的水凝胶，所述装载药物的纳微米球与所述装载药物的水凝胶通过物理交联形成复合结构；所述装载药物的纳微米球的粒径范围为50nm‑500μm；所述装载药物的纳微米球中的载药量大于所述装载药物的水凝胶中的载药量；所述药物包括亲水性药物或疏水性药物。本发明多重屏障的药物释放制剂可弥补单重屏障载体的突释或滞释问题，最终实现药物零级长效释放，并长期稳定维持药物在体内的有效浓度。