本发明公开了一种富集n‑3多不饱和脂肪酸的中长碳链甘油三酯的制备方法及其产品，本发明采用脂肪酸和非离子表面活性剂双重印迹，提升脂肪酶对中链脂肪酸的活力，降低脂肪酶对EPA和DHA的选择性，从而可提升酸解反应产品中链脂肪酸含量及进一步富集EPA和DHA，直接利用酸解反应的反应体系，通过施加一定的真空度，利用反应体系现有的脂肪酸、甘油酯及脂肪酶进行酯化反应，使副产物甘油一酯和甘油二酯进一步酯化为甘油三酯，从而提高最终产品的得率，并在最终吐脱酸阶段降低缩水甘油酯，氯丙醇酯等有害物质的含量。