本发明涉及燃料电池技术领域，尤其涉及一种燃料电池系统用氢气循环泵的防漏电方法。包括电机壳体和泵壳、以及两者之间的轴承座，泵壳内设有主动轴和从动轴，主动轴伸至齿轮室内与主动齿轮相连接，从动轴伸至齿轮室内与从动齿轮相连接，主动轴上安装有主动转子，从动轴上安装有从动转子，泵壳上设有进气口和出气口，所述轴承座与电机壳体之间绝缘连接，所述电机轴伸至齿轮室内与主动齿轮通过绝缘连接结构相连接。可将泵头与电机之间内外连接的位置完全绝缘，燃料电池系统的部分电流即使与泵头连电后，也不会再经泵头传递到电机上，避免电流经电机的接地线导入地下通过大地流失，从而避免了燃料电池系统的电流损失，达到节约能源的目的。