本发明公开了一种基于奈奎斯特折叠的数字信道化快速信号处理方法及系统，该方法首先通过NYFR结构，将本振产生的模拟周期非均匀采样脉冲串，对天线接收到的信号进行欠采样，将信号频谱的频段折叠至奈奎斯特频率以下。其次将折叠至奈奎斯特频率以下的调制信号，使用RFSoC集成的ADC进行离散数字化。最后将离散数字化后的数据，通过基于IDFT多相滤波结构的数字信道化处理，分成多个子信道，接收机并行解调多个同时到达的子信道，重构出天线接收到的信号，完成NYFR结构快速接收和处理信号。本发明显著提升了瞬时超宽频段实时监视和处理能力，可实现瞬时超大带宽频段信号的接收和处理，降低了成本和复杂度。