本发明涉及整车安全性测试技术领域，特别涉及一种整车安全性能测试认证方法和系统，所述方法包括：步骤一：选取待测系统，获取待测系统的控制逻辑，并且在待测系统与相应的关联系统之间设置控制节点；步骤二：识别待测系统信号源特征，根据待测系统的控制逻辑，生成多条功能流程；步骤三：根据预设的信号注入规则，在功能流程中固定或者动态选择多个信号注入点，向功能流程中注入测试信号；步骤四：采集执行信号，通过分析执行信号判断相应功能流程是否能够执行相应的安全功能；如果是，则进入下一步；否则，调整控制逻辑，并返回步骤一；步骤五：根据上一步骤的判断结果，对整车的功能安全性能进行评估，并输出评估结果。