本发明涉及生物过滤技术领域，具体公开了一种负压超滤离心管装置，包括自下往上依次堆叠连接的负压底座、负压罩和超滤支架；所述超滤支架开设有多个呈矩阵排列的放置孔，所述放置孔设有超滤离心管，所述负压底座内设有底架，所述底架设有多组与所述放置孔相对应的弹性限位结构，所述弹性限位结构夹持有收集管，所述超滤离心管与对应的所述收集管同轴设置，且所述超滤离心管的至少部分能够沿其轴向延伸至所述收集管内。本发明通过负压能够实现液体过滤、浓缩、细胞分离、脱盐等实验，适用范围广，与现有技术相比，本发明具有时间短、效率高的优点，且不会导致超滤膜出现破损渗漏，能有效避免细胞出现受伤损坏。