本实用新型公开了一种灵芝袍子粉灭菌装置，包括灭菌框体、多组磁控紫外灭菌装置、多组卡固抽架、高温蒸汽装置和控制器，其中，灭菌框体包括主框体、通槽、多组灭菌盒、多组放置槽、多组齿轮阀和多组分支蒸汽管道；多组磁控紫外灭菌装置分别设置在多组灭菌盒内部；多组卡固抽架分别设置在多组放置槽内部；控制器设置在主框体表面，控制器分别与多组磁控紫外灭菌装置和高温蒸汽装置电性连接。由此，本装置可在高温杀菌过程中，自由添加灵芝袍子粉，且不影响上一批次灵芝袍子粉的灭菌温度，保证了灭菌效果，同时也提高升了灭菌效率。