公开(公告)号：KR1020050065884A

公开(公告)日：2005-06-30

申请号：KR1020030097044

申请日：2003-12-26

Applicant: 한국전자통신연구원

Inventor： 임명은 ,  심정섭 ,  정명근 ,  박선희

IPC: C12N15/00

Abstract: 본 발명은 유사서열 추출을 통한 전사인자 결합부위 예측 장치 및 그 방법에 관한 것으로, 특히 입력 서열에 대한 전처리 후 접미사 배열을 구성하고 생성된 접미사 배열에 대한 LCP 정보에 의해 여러 서열에서 공통으로 존재하는 서열을 추출하여 국부 정렬 기법을 이용하여 전사인자 결합부위 후보 서열들을 추출함으로써, 전사인자 결합부위 예측에 따른 시간과 비용을 효율적으로 줄일 수 있는 유사서열 추출을 통한 전사인자 결합부위 예측 장치 및 그 방법에 관한 것이다.
본 발명의 유사서열 추출을 통한 전사인자 결합부위 예측 장치는, 입력된 서열들을 전처리, 접미사 배열 생성 및 국부 정렬하여 대상 서열에서 예측된 전사인자 결합부위들을 출력하기 위한 전사인자 결합부위 예측기; 및 상기 전사인자 결합부위 예측기로부터 출력된 전사인자 결합부위 서열들을 저장하기 위한 결합부위 데이터베이스를 포함하여 이루어진다.

公开(公告)号：KR1020040055428A

公开(公告)日：2004-06-26

申请号：KR1020020082098

申请日：2002-12-21

Applicant: 한국전자통신연구원

Inventor： 박선희 ,  이성훈 ,  심정섭

IPC: C12Q1/00

Abstract: PURPOSE: A method for constructing network of cell division using oscillation network is provided, thereby easily analyzing and regulating the relationship between the cell division related gene and protein. CONSTITUTION: The method for constructing network of cell division using oscillation network comprises the steps of: selecting target gene and protein; investigating relationship between proteins; constructing network of repressor protein and network of activation protein; and constructing oscillation network by connecting the repressor protein network and the activation protein network by mediating protein performing both functions of repressor and activation, wherein the oscillation network is constructed by using the cell division mechanism in prokaryotic cells and eukaryotic cells.

Abstract translation: 目的：提供一种使用振荡网络构建细胞分裂网络的方法，从而轻松分析和调节细胞分裂相关基因与蛋白质之间的关系。 构成：使用振荡网络构建细胞分裂网络的方法包括以下步骤：选择靶基因和蛋白质; 调查蛋白质之间的关系; 构建阻抑蛋白网络和活化蛋白网络; 并通过介导进行抑制子和激活功能的蛋白质连接阻抑蛋白网络和活化蛋白质网络来构建振荡网络，其中通过在原核细胞和真核细胞中使用细胞分裂机制构建振荡网络。

公开(公告)号：KR100537636B1

公开(公告)日：2005-12-20

申请号：KR1020030097044

申请日：2003-12-26

Applicant: 한국전자통신연구원

Inventor： 임명은 ,  심정섭 ,  정명근 ,  박선희

IPC: C12N15/00

Abstract: 본 발명은 유사서열 추출을 통한 전사인자 결합부위 예측 장치 및 그 방법에 관한 것으로, 특히 입력 서열에 대한 전처리 후 접미사 배열을 구성하고 생성된 접미사 배열에 대한 LCP 정보에 의해 여러 서열에서 공통으로 존재하는 서열을 추출하여 국부 정렬 기법을 이용하여 전사인자 결합부위 후보 서열들을 추출함으로써, 전사인자 결합부위 예측에 따른 시간과 비용을 효율적으로 줄일 수 있는 유사서열 추출을 통한 전사인자 결합부위 예측 장치 및 그 방법에 관한 것이다.
본 발명의 유사서열 추출을 통한 전사인자 결합부위 예측 장치는, 입력된 서열들을 전처리, 접미사 배열 생성 및 국부 정렬하여 대상 서열에서 예측된 전사인자 결합부위들을 출력하기 위한 전사인자 결합부위 예측기; 및 상기 전사인자 결합부위 예측기로부터 출력된 전사인자 결합부위 서열들을 저장하기 위한 결합부위 데이터베이스를 포함하여 이루어진다.

公开(公告)号：KR100480314B1

公开(公告)日：2005-04-07

申请号：KR1020020082098

申请日：2002-12-21

Applicant: 한국전자통신연구원

Inventor： 박선희 ,  이성훈 ,  심정섭

IPC: C12Q1/00

Abstract: 본 발명은 원핵세포(Prokaryotic)와 진핵세포(Eukaryotic)의 세포분열(Cell Division)에 관계되는 유전자(Gene)의 특성인 진동(Oscillation) 패턴을 이용하여 세포분열 네트워크를 구성하는 방법에 관한 것이다. 기존의 세포분열에 관여하는 세포주기 조절에 대한 생물학적 연구는 각각의 단백질의 기능을 분석하고 이러한 데이터를 종합하여 일차원적인 그림으로 나타내는 것이 주를 이루고 있어서, 세포주기 조절에 관여하는 유전자와 단백질간의 상호작용에 대해서 전체적인 모식도와 어떻게 서로를 조절하는지에 대한 이해는 정량적인 면에서 한계를 나타내었다.
본 발명은 대상 유전자 및 단백질을 선별하는 단계; 단백질간의 상호관계를 구명하는 단계; 저해자 단백질 네트워크와 활성인자 단백질 네트워크를 구성하는 단계; 및 저해자와 활성인자 기능을 동시에 수행하는 단백질을 매개하여 저해자 단백질 네트워크와 활성인자 단백질 네트워크를 연계하여 진동 네트워크를 구성하는 단계를 포함하여 세포분열 네트워크를 구성한다.