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公开(公告)号：KR1020160041905A
公开(公告)日：2016-04-18
申请号：KR1020167002475
申请日：2014-08-14
Applicant: (주)지노믹트리
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q2600/112 , C12Q2600/118 , C12Q2600/154
Abstract: 본발명은 SDC2 (NM_002998, 신데칸 2, Syndecan 2) 유전자의전암병변검출용메틸화바이오마커로서의새로운용도에관한것으로, 더욱상세하게는이를바이오마커로이용하여메틸화정도를측정함으로써대장내 전암병변을조기에진단하는용도에관한것이다. 본발명은대장내 전암병변을신데칸 2 유전자의 CpG 메틸화를검출함으로써, 전암병변진단을위한정보를주는방법을제공하는효과가있다. 아울러, 본발명에따른메틸화검출방법과검출용키트를이용하면, 장암을초기형질전환단계에서진단할수 있어조기진단이가능하고, 통상적인방법보다정확하고빠르게전암병변을진단할수 있어유용하다.
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公开(公告)号：KR101600039B1
公开(公告)日：2016-03-08
申请号：KR1020150100017
申请日：2015-07-14
Applicant: (주)지노믹트리
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q2521/101 , C12Q2523/125
Abstract: 본발명은기존의염기특이반응성 PCR(allele-specific PCR)의문제점을해결하기위하여고안된염기특이반응성프라이머(Allele-specific reactive primer; ASRP)를이용한핵산증폭방법에관한것으로, 더욱자세하게는, 교정활성(proofreading)을가지는 DNA 중합효소(DNA polymerase) 및표적핵산과상보적인염기서열을포함하고, 3' 말단에비상보적염기가존재할때 상기 DNA 중합효소의교정활성에의해잘려나가는염기의 5' 방향으로바로앞쪽의염기부터 5' 말단까지의염기중의하나이상이중합반응의시발체로작용할수 없도록변형된염기특이반응성프라이머 (Allele-specific reactive primer; ASRP)의존재하에표적핵산을증폭시키는것을특징으로하는표적핵산의검출방법에관한것이다. 본발명에따른대립형질특이반응성프라이머를이용한검출방법은 ASRP 및교정반응 DNA 중합효소의특성상증폭의특이도가매우높은기술로서, 단일염기다형성(SNP; Single Nucletide Polymorphism)를포함하는돌연변이(점돌연변이, 삽입, 결실)를효과적으로검출할수 있으며, 바이설파이트(bisulfate) 처리후 CpG 메틸화유무를검출하거나, DNA 라이브러리에서원하는염기서열로시작되는목적 DNA를증폭하여검출하는데도활용할수 있다.
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公开(公告)号：KR1020150088772A
公开(公告)日：2015-08-03
申请号：KR1020150100018
申请日：2015-07-14
Applicant: (주)지노믹트리
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q2521/101 , C12Q2523/125
Abstract: 본발명은기존의염기특이반응성 PCR(allele-specific PCR)의문제점을해결하기위하여고안된염기특이반응성프라이머(Allele-specific reactive primer; ASRP)를이용한핵산증폭방법에관한것으로, 더욱자세하게는, 교정활성(proofreading)을가지는 DNA 중합효소(DNA polymerase) 및표적핵산과상보적인염기서열을포함하고, 3' 말단에비상보적염기가존재할때 상기 DNA 중합효소의교정활성에의해잘려나가는염기의 5' 방향으로바로앞쪽의염기부터 5' 말단까지의염기중의하나이상이중합반응의시발체로작용할수 없도록변형된염기특이반응성프라이머 (Allele-specific reactive primer; ASRP)의존재하에표적핵산을증폭시키는것을특징으로하는표적핵산의검출방법에관한것이다. 본발명에따른대립형질특이반응성프라이머를이용한검출방법은 ASRP 및교정반응 DNA 중합효소의특성상증폭의특이도가매우높은기술로서, 단일염기다형성(SNP; Single Nucletide Polymorphism)를포함하는돌연변이(점돌연변이, 삽입, 결실)를효과적으로검출할수 있으며, 바이설파이트(bisulfate) 처리후 CpG 메틸화유무를검출하거나, DNA 라이브러리에서원하는염기서열로시작되는목적 DNA를증폭하여검출하는데도활용할수 있다.
Abstract translation: 本发明涉及使用设计用于解决现有等位基因特异性PCR的问题的等位基因特异性反应性引物（ASRP）扩增核酸的方法，更具体地，涉及用于检测靶核酸的方法，其是 其特征在于包括具有校正活性的DNA聚合酶和靶核酸，以及互补碱基序列，并且在转化的ASRP存在的情况下扩增靶核酸，使得从5碱基到5'末端的一个或多个碱基切出5 当3'末端存在非互补碱基序列时，通过DNA聚合酶的校正活性将碱基方向作为聚合引发剂。 根据本发明的ASRP的检测方法作为在ASRP和校正DNA聚合酶的特征方面具有高扩增特异性的技术有效地检测包括单核苷酸多态性（SNP）的突变（点突变，插入，丢失），并且是 用于检测硫酸氢盐处理后的CpG甲基化，或扩增和检测DNA文库中所需碱基序列开始的靶DNA。
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公开(公告)号：KR1020140122529A
公开(公告)日：2014-10-20
申请号：KR1020130039323
申请日：2013-04-10
Applicant: (주)지노믹트리
IPC: C12Q1/68 , C12N15/11 , G01N33/574
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q2600/154 , C12N15/11 , G01N33/57407
Abstract: 본 발명은 방광암 또는 방광암 진행단계의 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여, 방광암 바이오마커 유전자의 CpG 섬 부위의 메틸화를 검출하는 방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로는, 방광암 형질전환 세포에서 프로모터 부위가 특이적으로 메틸화되는 방광암 특이적 마커 유전자의 프로모터 메틸화를 확인하는 것을 특징으로 하는 방광암의 검출방법에 관한 것이다.
본 발명에 따르면, 방광암을 초기 형질전환 단계에서 진단할 수 있어 조기 진단이 가능하고, 통상적인 방법보다 정확하고 빠르게 방광암을 진단할 수 있다.Abstract translation: 本发明涉及一种检测膀胱癌生物标记基因CpG岛甲基化的方法，以提供诊断膀胱癌或膀胱癌进展所需的信息，更具体地说，涉及膀胱癌鉴别膀胱甲基化检测方法 具有在转基因膀胱癌细胞中特异性甲基化的区域的癌特异性生物标记基因启动子。 根据本发明，可以在早期转化阶段诊断膀胱癌，从而可以比常规方法更准确，更快地诊断膀胱癌的早期诊断和膀胱癌的诊断。
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公开(公告)号：KR101387663B1
公开(公告)日：2014-04-22
申请号：KR1020120044695
申请日：2012-04-27
Applicant: (주)지노믹트리
Abstract: 본 발명은 방광암 특이적인 마커 유전자를 이용한 방광암 또는 방광암 진행단계의 검출방법과 상기 방광암 특이적 마커 유전자를 이용한 방광암 진단용 키트 및 핵산 칩에 관한 것으로, 보다 구체적으로는, 방광암 형질전환 세포에서 프로모터 부위가 특이적으로 메틸화되는 방광암 특이적 마커 유전자의 프로모터 메틸화를 확인할 수 있는 방광암 진단용 키트 및 핵산 칩에 관한 것이다.
본 발명의 진단용 키트 및 진단용 핵산 칩을 이용하면, 방광암을 초기 형질전환 단계에서 진단할 수 있어, 조기 진단이 가능하고, 통상적인 방법보다 정확하고 빠르게 방광암을 진단할 수 있다.-
Patent Agency Ranking
公开(公告)号：KR101255769B1
公开(公告)日：2013-04-19
申请号：KR1020100129208
申请日：2010-12-16
Applicant: (주)지노믹트리
IPC: C12N15/12 , C12Q1/68 , G01N33/574
CPC classification number: C12Q1/6886 , C07K14/705 , C12Q2600/154
Abstract: 본 발명은 장암 진단을 위한 장암 특이적 메틸화 마커
GPM6A (NM_201591, glycoprotein M6A) 유전자의 메틸화 검출방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로는 장암 세포에서 특이적으로 메틸화되는 장암 특이적 마커 유전자의 메틸화를 검출하여 장암 진단을 위한 정보를 제공하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 메틸화 검출방법과 진단용 조성물, 키트 및 핵산 칩을 이용하면, 장암을 초기 형질전환단계에서 진단할 수 있어 조기 진단이 가능하고, 통상적인 방법보다 정확하고 빠르게 장암을 진단할 수 있어 유용하다.-
97.发明公开
公开(公告)号：KR1020120061247A
公开(公告)日：2012-06-13
申请号：KR1020100122463
申请日：2010-12-03
Applicant: (주)지노믹트리
IPC: C12Q1/68 , C12N15/12 , C12N15/117
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12N15/117 , C12Q2600/154
Abstract: PURPOSE: A biomarker containing methylated CpG island is provided to enable early diagnosis of cervical cancer and to predict high risk group. CONSTITUTION: A biomarker for diagnosing cervical cancer or cervical cancer progression contains a base sequence(NT_005612.16) at +7000 to +7,500 nt from a transcription start point of SOX14 gene in 3th chromosome; or methylated CpG island of DBXI(NM_001029865)- brain development homeo box gene. A site containing CpG island is denoted by sequence number 1 or 2. A method for detecting methylation of the biomarker comprises: a step of isolating DNA from a clinical sample; and a step of detecting the methylation of the base sequence(NT_005612.16) or homeo box gene CpG island.
Abstract translation: 目的：提供含有甲基化CpG岛的生物标志物，以便早期诊断子宫颈癌并预测高危组。 构成：用于诊断子宫颈癌或子宫颈癌进展的生物标志物包含从第3染色体中SOX14基因的转录起始点起+7000至+ 7500nt的碱基序列（NT_005612.16）; 或甲基化CpG岛的DBXI（NM_001029865） - 脑发育同源盒基因。 包含CpG岛的位点由序列号1或2表示。用于检测生物标志物的甲基化的方法包括：从临床样品中分离DNA的步骤; 以及检测碱基序列（NT_005612.16）或同源盒基因CpG岛的甲基化的步骤。
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公开(公告)号：KR1020110084487A
公开(公告)日：2011-07-25
申请号：KR1020110067000
申请日：2011-07-06
Applicant: (주)지노믹트리
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q2600/154
Abstract: PURPOSE: A method for detecting methylation of a marker is provided to detect methylation of CpG island of a marker gene and to diagnose intestinal cancer. CONSTITUTION: A method for detecting methylation of a marker comprises a step of detecting CpG island of SORCS3(NM_014978, sortilin-related VPS10 domain containing receptor 3) gene or CpG island of a promoter of the gene from DNAs of a clinical sample. The clinical sample is selected from the group consisting of a tissue, blood, serum, feces, and urine. A composition for diagnosing intestinal cancer contains the SORCS3 gene CpG island or CpG island of the promoter thereof.
Abstract translation: 目的：提供一种检测标记物甲基化的方法，以检测标记基因CpG岛的甲基化并诊断肠癌。 构成：检测标记甲基化的方法包括检测来自临床样品DNA的基因的启动子的SORCS3（NM_014978，与sortilin相关的含VPS10结构域的受体3）的CpG岛基因或CpG岛的步骤。 临床样品选自组织，血液，血清，粪便和尿液。 用于诊断肠癌的组合物含有其启动子的SORCS3基因CpG岛或CpG岛。
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公开(公告)号：KR1020110036554A
公开(公告)日：2011-04-07
申请号：KR1020110020093
申请日：2011-03-07
Applicant: (주)지노믹트리
CPC classification number: C12Q1/6883 , C12Q1/6837 , C12Q2600/156
Abstract: PURPOSE: A kit for diagnosing bladder cancer using a bladder cancer-specific marker gene is provided to quickly and accurately diagnose bladder cancer. CONSTITUTION: A kit for diagnosing bladder caner contains a methylate promoter of a bladder cancer marker gene, SIM2 (U80456) - single-minded homolog 2(Drosophila). A promoter or exon region contains at least one methylated CpG dinucleotide. A nucleic acid chip for diagnosing bladder cancer contains a probe which is hybridizable with a fragment having a promoter CpG island. A biomarker for diagnosing bladder cancer contains a methylated promoter of a SIM2(U80456)-single-minded homolog 2(Drosophila) gene.
Abstract translation: 目的：提供膀胱癌特异性标记基因诊断膀胱癌的一套工具，以快速，准确地诊断膀胱癌。 构成：用于诊断膀胱癌的试剂盒含有膀胱癌标记基因的甲基化启动子，SIM2（U80456） - 单目同系物2（果蝇）。 启动子或外显子区域含有至少一个甲基化的CpG二核苷酸。 用于诊断膀胱癌的核酸芯片含有可与具有启动子CpG岛的片段杂交的探针。 用于诊断膀胱癌的生物标志物含有SIM2（U80456） - 单目同系物2（果蝇）基因的甲基化启动子。
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公开(公告)号：KR1020110036553A
公开(公告)日：2011-04-07
申请号：KR1020110020092
申请日：2011-03-07
Applicant: (주)지노믹트리
CPC classification number: C12Q1/6883 , C12Q1/6837 , C12Q2600/156
Abstract: PURPOSE: A kit for diagnosing bladder cancer using bladder cancer-specific marker gene is provided to accurately and quickly diagnose bladder cancer. CONSTITUTION: A kit for diagnosing bladder cancer contains a methylated promoter of bladder cancer markder gene PENK(NM_006211)-proenkephalin. The promoter contains at least one methylated CpG dinucleotide. The kit comprises: a CDX2 (NM_001265) - caudal type homeobox transcription factor 2; CYP1B1 (NM_000104) - cytochrome P450, family 1, sub-family B, polypeptide 1; VSX1 (NM_199425) - visual system homeobox 1 homolog, CHX10-like (zebrafish); HOXA11 (NM_005523) - homeobox A 11 [homeobox A11]; T (NM_003181) - brachyury homolog (mouse); PAQR9 (NM_198504) - progestin and adipoQ receptor family member IV; and LHX2 (NM_004789) - rim homeobox 2.
Abstract translation: 目的：提供膀胱癌特异性标记基因诊断膀胱癌的准备和准确诊断膀胱癌。 构成：用于诊断膀胱癌的试剂盒含有膀胱癌标记基因PENK（NM_006211） - 脑啡肽的甲基化启动子。 启动子含有至少一个甲基化的CpG二核苷酸。 该试剂盒包括：CDX2（NM_001265） - 尾型同源异体转录因子2; CYP1B1（NM_000104） - 细胞色素P450，家族1，亚家族B，多肽1; VSX1（NM_199425） - 视觉系统同源盒1同系物，CHX10样（斑马鱼）; HOXA11（NM_005523） - 同源盒A11 [同源盒A11]; T（NM_003181） - brachyury同源物（小鼠）; PAQR9（NM_198504） - 孕激素和adipoQ受体家族成员IV; 和LHX2（NM_004789） - 边缘同源盒2。
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