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公开(公告)号:CN102307986A
公开(公告)日:2012-01-04
申请号:CN200980156147.7
申请日:2009-07-15
Applicant: 基因组股份公司
CPC classification number: C12P7/18 , C12N9/0006 , C12N9/10 , C12N9/1029 , C12N9/88 , C12N15/52 , C12P7/04 , C12P7/42
Abstract: 一种示例性非天然存在的微生物有机体,其具有包含编码异丙醇途径酶的至少一种外源核酸的异丙醇途径,所述外源核酸足量表达以产生异丙醇,异丙醇途径酶包括琥珀酰-CoAL3-酮酸-CoA转移酶。另一种有机体具有包含至少一种外源核酸的4-羟基丁酸酯途径,包含乙酰乙酰-CoA硫解酶、3-羟基丁酰-CoA脱氢酶、巴豆酸酶、巴豆酰-CoA水合酶、4-羟基丁酰-CoA转移酶、磷酸转-4-羟基丁酰酶和4-羟基丁酸酯激酶。一种具有1,4-丁二醇途径的示例性有机体包括乙酰乙酰-CoA硫解酶、3-羟基丁酰-CoA脱氢酶、巴豆酸酶、巴豆酰-CoA水合酶、4-羟基丁酰-CoA还原酶(醇形成型)、4-羟基丁酰-CoA还原酶(醛形成型)和1,4-丁二醇脱氢酶。所述有机体还包括乙酰-CoA途径。上述有机体中的任一种被培养以产生异丙醇、4-羟基丁酸酯或1,4-丁二醇。
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公开(公告)号:CN109880782A
公开(公告)日:2019-06-14
申请号:CN201910187957.4
申请日:2010-11-19
Applicant: 基因组股份公司
Abstract: 一种具有3-羟基丁酸途径、乙酰乙酸途径、4-羟基,2-丁酮途径或3-氧代丁醛途径的非天然存在的微生物有机体,包括至少一个外源性核酸,所述外源性核酸编码足量表达以生产3-羟基丁酸、乙酰乙酸、4-羟基,2-丁酮或3-氧代丁醛的3-羟基丁酸途径、乙酰乙酸途径、4-羟基,2-丁酮途径或3-氧代丁醛途径酶或蛋白。一种用于生产3-羟基丁酸、乙酰乙酸、4-羟基,2-丁酮或3-氧代丁醛的方法,其包括该非天然存在的微生物在一定条件下培养充足的一段时间以生产3-羟基丁酸、乙酰乙酸、4-羟基,2-丁酮或3-氧代丁醛。
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公开(公告)号:CN106119113A
公开(公告)日:2016-11-16
申请号:CN201610481598.X
申请日:2010-04-30
Applicant: 基因组股份公司
Inventor: A·P·博加德 , M·J·伯克 , 罗宾·E·奥斯特豪特 , 普里蒂·法克雅
CPC classification number: C12P7/18 , C07C29/80 , C12N9/0006 , C12N9/0008 , C12N9/1029 , C12N9/1096 , C12N9/88 , C12N15/52 , C12Y101/01 , C12Y101/01157 , C12Y102/01 , C12Y203/01 , C12Y206/01 , C12Y401/01 , C12Y402/01 , C12Y403/01
Abstract: 一种非天然存在的微生物,该微生物包括具有1,3‑丁二醇(1,3‑BDO)通路的微生物,该1,3‑丁二醇(1,3‑BDO)通路具有至少一种编码以足够的量表达的1,3‑BDO通路酶的外源性核酸,以生产1,3‑BDO。一种用于生产1,3‑BDO的方法,该方法包括在多种条件下培养这类微生物达足够长的时间,以生产1,3‑BDO。
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公开(公告)号:CN102625846B
公开(公告)日:2016-08-03
申请号:CN201080029715.X
申请日:2010-04-30
Applicant: 基因组股份公司
Inventor: A·P·博加德 , M·J·伯克 , 罗宾·E·奥斯特豪特 , 普里蒂·法克雅
CPC classification number: C12P7/18 , C07C29/80 , C12N9/0006 , C12N9/0008 , C12N9/1029 , C12N9/1096 , C12N9/88 , C12N15/52 , C12Y101/01 , C12Y101/01157 , C12Y102/01 , C12Y203/01 , C12Y206/01 , C12Y401/01 , C12Y402/01 , C12Y403/01
Abstract: 一种非天然存在的微生物,该微生物包括具有1,3?丁二醇(1,3?BDO)通路的微生物,该1,3?丁二醇(1,3?BDO)通路具有至少一种编码以足够的量表达的1,3?BDO通路酶的外源性核酸,以生产1,3?BDO。该通路包括选自如下的酶:2?氨基?4?酮戊酸(AKP)硫解酶、AKP脱氢酶、2?氨基?4?羟基戊酸转氨酶、2?氨基?4?羟基戊酸氧化还原酶(脱氨基)、2?氧代?4?羟基戊酸脱羧酶、3?羟基丁醛还原酶、AKP转氨酶、AKP氧化还原酶(脱氨基)、2,4?二氧代戊酸脱羧酶、3?氧代丁醛还原酶(酮还原)、3?氧代丁醛还原酶(醛还原)、4?羟基?2?丁酮还原酶、AKP脱羧酶、4?氨基丁?2?酮转氨酶、4?氨基丁?2?酮氧化还原酶(脱氨基)、4?氨基丁?2?酮氨?裂解酶、丁烯酮水合酶、AKP氨?裂解酶、乙酰丙烯酸脱羧酶、乙酰乙酰基?CoA还原酶(CoA?依赖的、醛形成)、乙酰乙酰基?CoA还原酶(CoA?依赖的、醇形成)、乙酰乙酰基?CoA还原酶(酮还原)、3?羟基丁酰?CoA还原酶(醛形成)、3?羟基丁酰?CoA还原酶(醇形成)、4?羟基丁酰?CoA脱水酶和巴豆酸酶。一种用于生产1,3?BDO的方法,该方法包括在多种条件下培养这类微生物达足够长的时间,以生产1,3?BDO。
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公开(公告)号:CN102625845A
公开(公告)日:2012-08-01
申请号:CN201080050437.6
申请日:2010-09-09
Applicant: 基因组股份公司
Inventor: 普里蒂·法克雅 , A·P·博加德 , 罗宾·E·奥斯特豪特 , M·J·伯克 , 孙军
Abstract: 本发明提供一种具有正丙醇和异丙醇途径,1,4-丁二醇(1,4-BDO)和异丙醇途径,1,3-丁二醇(1,3-BDO)和异丙醇途径,或者甲基丙烯酸(MAA)和异丙醇途径的非天然存在的微生物有机体。该微生物有机体包括至少一种编码正丙醇,1,4-BDO,1,3-BDO或MAA和异丙醇途径中每种途径各自的一种酶的外源核酸。本发明还提供一种协同产生正丙醇和异丙醇,1,4-BDO和异丙醇,1,3-BDO和异丙醇或者MAA和异丙醇的方法。该方法可包括在一定条件下培养一种协同产生正丙醇和异丙醇的微生物有机体并持续足以分别产生每种产物的时间,其中该微生物有机体表达至少一种编码正丙醇,异丙醇,1,4丁二醇,1,3-BDO和/或MAA途径酶并以足以分别产生每种产物的外源核酸。
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公开(公告)号:CN102459138A
公开(公告)日:2012-05-16
申请号:CN201080034314.3
申请日:2010-06-03
Applicant: 基因组股份公司
CPC classification number: C07C29/76 , C12P7/18 , C07C31/207
Abstract: 本发明涉及从发酵液分离1,4-丁二醇(1,4-BDO)的方法,其包括:从包含细胞的固体部分分离富含1,4-BDO的液体部分,从所述的液体部分除去水,从所述的液体部分除去盐,和纯化1,4-BDO。生产1,4-BDO的方法包括将产生1,4-BDO的微生物在发酵罐中培养足够时间以生产1,4-BDO。产生1,4-BDO的微生物包括具有1,4-BDO途径的微生物,该1,4-BDO途径具有一个或多个编码1,4-BDO途径酶的外源基因和/或一个或多个基因破坏。生产1,4-BDO的方法进一步包括分离1,4-BDO。
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公开(公告)号:CN113528417A
公开(公告)日:2021-10-22
申请号:CN202110879974.1
申请日:2010-06-04
Applicant: 基因组股份公司
Inventor: S·J·万殿 , A·P·博加德 , 罗伯特·哈瑟尔贝克 , 凯瑟琳·J·普若尔-巴克斯利 , 牛巍 , 约翰·D·特拉威克 , 哈里·伊姆 , M·J·伯克 , 罗宾·E·奥斯特豪特 , 孙军
Abstract: 本发明提供非天然存在的包含1,4‑丁二醇(BDO)途径的微生物体,该途径包含编码BDO途径酶的至少一种外源核酸,所述核酸以足以产生BDO的量表达,并且为BDO的表达被进一步优化。本发明另外提供利用所述微生物体生产BDO的方法。
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公开(公告)号:CN104685058B
公开(公告)日:2020-07-07
申请号:CN201380039811.6
申请日:2013-06-03
Applicant: 基因组股份公司
Inventor: 普里蒂·法克雅 , A·P·博加德 , S·J·万殿 , 罗宾·E·奥斯特豪特 , 约翰·D·特拉威克 , 迈克尔·P·库钦斯卡斯 , 布莱恩·斯蒂尔 , M·J·伯克
Abstract: 本发明提供具有4‑羟基丁酸酯、1,4‑丁二醇或其它产物途径且能够产生4‑羟基丁酸酯、1,4‑丁二醇或其它产物的非天然微生物,其中所述微生物包含一或多种遗传修饰。本发明另外提供使用所述微生物产生4‑羟基丁酸酯、1,4‑丁二醇或其它产物或相关产物的方法。
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公开(公告)号:CN109136161A
公开(公告)日:2019-01-04
申请号:CN201811072486.4
申请日:2010-11-19
Applicant: 基因组股份公司
Abstract: 一种具有3‑羟基丁酸途径、乙酰乙酸途径、4‑羟基,2‑丁酮途径或3‑氧代丁醛途径的非天然存在的微生物有机体,包括至少一个外源性核酸,所述外源性核酸编码足量表达以生产3‑羟基丁酸、乙酰乙酸、4‑羟基,2‑丁酮或3‑氧代丁醛的3‑羟基丁酸途径、乙酰乙酸途径、4‑羟基,2‑丁酮途径或3‑氧代丁醛途径酶或蛋白。一种用于生产3‑羟基丁酸、乙酰乙酸、4‑羟基,2‑丁酮或3‑氧代丁醛的方法,其包括该非天然存在的微生物在一定条件下培养充足的一段时间以生产3‑羟基丁酸、乙酰乙酸、4‑羟基,2‑丁酮或3‑氧代丁醛。
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公开(公告)号:CN105936887A
公开(公告)日:2016-09-14
申请号:CN201610188170.6
申请日:2008-03-14
Applicant: 基因组股份公司
CPC classification number: C12N15/52 , B01D3/002 , C12N9/0006 , C12N9/0008 , C12N9/88 , C12N9/93 , C12N15/70 , C12N15/81 , C12P7/18 , C12P7/42 , C12P7/52 , C12P17/04 , C12Y101/01061 , C12Y102/01076 , C12Y401/01071 , C12Y602/01004 , Y02P20/52 , C12Y102/01016
Abstract: 本发明提供非自然存在的微生物生物催化剂,其包括具有4‑羟基丁酸(4‑HB)生物合成途径的微生物有机体。还提供非自然存在的微生物生物催化剂,其包括具有4‑羟基丁酸(4‑HB)和1,4‑丁二醇(BDO)生物合成途径的微生物有机体。另外提供生产4‑HB的方法。该方法包括将具有4‑羟基丁酸(4‑HB)生物合成途径的非自然存在的微生物有机体在基本上厌氧的条件下培养足够的时间以产生单体4‑羟基丁酸(4‑HB)。进一步提供生产BDO的方法。该方法包括将非自然存在的微生物生物催化剂培养足够的时间以产生1,4‑丁二醇(BDO),所述生物催化剂包含具有4‑羟基丁酸(4‑HB)和1,4‑丁二醇(BDO)生物合成途径的微生物有机体。4‑HB和/或BDO产物可以被分泌到培养基中。
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