公开(公告)号：KR100645445B1

公开(公告)日：2006-11-15

申请号：KR1020040072204

申请日：2004-09-09

Applicant: 강원대학교산학협력단

Inventor： 권순재 ,  이주경 ,  김남수 ,  박용진 ,  조은기

IPC: C12N15/10 ,  C12Q1/68

Abstract: 본 발명은 식물체의 다형성 검출용 마커의 제조방법에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 제한효소로 절단된 식물 게놈 DNA를 어댑터와 결합시킨 후, 상기 어댑터 염기서열의 일부 또는 전부를 포함하는 하나의 프라이머를 이용한 한 방향(one way) PCR로 증폭시키는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 식물체의 다형성 검출용 마커의 제조방법에 관한 것이다. 본 발명의 방법은 비용과 시간 면에서 종래 방법에 비해 더 우수할 뿐 아니라 더 많은 수의 초위성체 및 SSR 마커를 제조할 수 있다.

다형성 마커, 초위성체, SSR, PCR

公开(公告)号：KR1020060023379A

公开(公告)日：2006-03-14

申请号：KR1020040072205

申请日：2004-09-09

Applicant: 강원대학교산학협력단

Inventor： 권순재 ,  이주경 ,  김남수 ,  박용진 ,  조은기

IPC: C12N15/29 ,  C12Q1/68 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12N15/11 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/6888 ,  C12Q2600/156

Abstract: 본 발명은 들깨 속 식물(
Perilla spp.)에서 분리한 SSR 프라이머 및 이의 용도에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 서열번호 1 내지 서열번호 26으로 이루어진 군에서 선택되는 2개의 염기서열을 갖는 SSR 프라이머쌍 및 이를 이용하여 PCR을 수행하는 것을 포함하는 들깨 속 식물의 DNA 다형성 검출 방법에 관한 것이다. 본 발명에서 제공되는 SSR 프라이머쌍은 들깨 속 식물의 DNA 다형성을 효과적으로 검출할 수 있으며, 들깨 속 식물의 DNA 프로파일을 작성하는데 매우 유용하게 이용될 수 있다. 또한, 이를 통해 들깨 속 식물의 유전자원을 효율적으로 평가함으로써 신규 유전자원 도입시 기존 보유자원과의 중복성 분석 및 신규성 확립을 효과적으로 수행할 수 있다.

SSR 프라이머, 들깨, DNA 다형성

公开(公告)号：KR100555081B1

公开(公告)日：2006-02-24

申请号：KR1020030001444

申请日：2003-01-09

Applicant: 강원대학교산학협력단

Inventor： 김남수 ,  박경철

IPC: C12N15/29

Abstract: 본 발명은 감마그래스(Gamma grass) 유래 신규 MITE(miniature inverted- repeat transposable element)에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 서열번호 11 또는 서열번호 12로 기재되는 염기서열로 구성된 MITE에 관한 것이다. 본 발명에 따른 MITE는 식물의 유전적 다양성 분석, 연관 유전자의 지도 작성, 유전자의 탐색, 특정 형질에 대한 DNA 마커의 개발 등에 유용하게 이용될 수 있다.
MITE, 전이인자, 감마그래스

公开(公告)号：KR100555079B1

公开(公告)日：2006-02-24

申请号：KR1020030001442

申请日：2003-01-09

Applicant: 강원대학교산학협력단

Inventor： 김남수 ,  박경철

IPC: C12N15/29

Abstract: 본 발명은 귀리 유래 신규 MITE(miniature inverted-repeat transposable element)에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 서열번호 11로 기재되는 염기서열로 구성된 MITE에 관한 것이다. 본 발명에 따른 MITE는 식물의 유전적 다양성 분석, 연관 유전자의 지도 작성, 유전자의 탐색, 특정 형질에 대한 DNA 마커의 개발 등에 유용하게 이용될 수 있다.
MITE, 전이인자, 귀리

公开(公告)号：KR1020040064144A

公开(公告)日：2004-07-16

申请号：KR1020030001443

申请日：2003-01-09

Applicant: 강원대학교산학협력단

Inventor： 김남수 ,  박경철

IPC: C12N15/29

CPC classification number: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2535/138 ,  C12Q2600/13 ,  C12Q2600/156

Abstract: PURPOSE: MITEs(miniature inverted-repeat transposable element) isolated from sorghum are provided, which are useful for analysis of genetic diversity of plants, preparation of a related gene map, gene screening and development of a DNA marker to a specific character. CONSTITUTION: The MITEs isolated from sorghum have the nucleotide sequences set forth in SEQ ID NO:11 to SEQ ID NO:14. The MITEs are isolated from sorghum by the following steps of: constructing PangFR primer having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO:10 using TIR sequence and DIR sequence of Pangrangja; isolating DNA from sorghum; PCR amplifying the DNA of sorghum using PangFR primer to obtain numerous amplified DNA fragments; subjecting the DNA fragments to southern blot to analyze hybridization of the DNA fragments with the probe of Pangrangja; and selecting four DNA fragments amplified by PCR and sequencing them, wherein the four DNA fragments have the nucleotide sizes of 634bp, 849bp, 363bp, and 941bp and 16bp TIR sequence which is reverse-repeated in both ends of them.

Abstract translation: 目的：提供从高粱分离的MITE（微型倒置重复转座元件），可用于分析植物的遗传多样性，制备相关基因图谱，基因筛选和DNA标记物的特异性开发。 构成：从高粱分离的MITE具有SEQ ID NO：11至SEQ ID NO：14所示的核苷酸序列。 通过以下步骤从高粱中分离出MITE：使用TIR序列和Pangrangja的DIR序列构建具有SEQ ID NO：10所示核苷酸序列的PangFR引物; 从高粱中分离DNA; 使用PangFR引物PCR扩增高粱DNA，获得大量扩增的DNA片段; 对DNA片段进行Southern印迹分析，DNA片段与Pangrangja的探针杂交; 并选择通过PCR扩增并对其进行测序的四个DNA片段，其中四个DNA片段具有634bp，849bp，363bp和941bp以及16bp TIR序列的核苷酸大小，其两端都反向重复。

公开(公告)号：KR1020040064140A

公开(公告)日：2004-07-16

申请号：KR1020030001439

申请日：2003-01-09

Applicant: 강원대학교산학협력단

Inventor： 김남수 ,  박경철

IPC: C12N15/29

CPC classification number: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2535/138 ,  C12Q2600/13 ,  C12Q2600/156

Abstract: PURPOSE: MITEs(miniature inverted-repeat transposable element) isolated from barley are provided, which are useful for analysis of genetic diversity of plants, preparation of a related gene map, gene screening and development of a DNA marker to a specific character. CONSTITUTION: The MITE isolated from barley has the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO:11. The MITE isolated from barley has the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO:12. The MITEs are isolated from barley by the following steps of: constructing PangFR primer having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO:10 using TIR sequence and DIR sequence of Pangrangja; isolating DNA from barley; PCR amplifying the DNA of barley using PangFR primer to obtain numerous amplified DNA fragments; subjecting the DNA fragments to southern blot to analyze hybridization of the DNA fragments with the probe of Pangrangja; and selecting two DNA fragments amplified by PCR and sequencing them, wherein the two DNA fragments have the nucleotide sizes of 368bp and 774bp and 16bp TIR sequence which is reverse-repeated in both ends of them.

Abstract translation: 目的：提供从大麦分离的MITE（微型倒置重复转座元件），可用于分析植物的遗传多样性，制备相关基因图谱，基因筛选和DNA标记的特异性开发。 构成：从大麦分离的MITE具有SEQ ID NO：11所示的核苷酸序列。 从大麦分离的MITE具有SEQ ID NO：12所示的核苷酸序列。 通过以下步骤将MITE从大麦分离：用TIR序列和Pangrangja的DIR序列构建具有SEQ ID NO：10所示核苷酸序列的PangFR引物; 从大麦中分离DNA; 使用PangFR引物PCR扩增大麦DNA，获得大量扩增的DNA片段; 对DNA片段进行Southern印迹分析，DNA片段与Pangrangja的探针杂交; 并选择通过PCR扩增的两个DNA片段并对其进行测序，其中两个DNA片段的核苷酸大小为368bp和774bp，16bp TIR序列在其两端被反向重复。