KR102223014B1 - Method for detecting precancerous lesions

    公开(公告)号:KR102223014B1

    公开(公告)日:2021-03-05

    申请号:KR1020167002475A

    申请日:2014-08-14

    Inventor: 안성환 오태정

    Abstract: 본 발명은 SDC2 (NM_002998, 신데칸 2, Syndecan 2) 유전자의 전암병변 검출용 메틸화 바이오마커로서의 새로운 용도에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 이를 바이오마커로 이용하여 메틸화 정도를 측정함으로써 대장 내 전암병변을 조기에 진단하는 용도에 관한 것이다. 본 발명은 대장 내 전암병변을 신데칸 2 유전자의 CpG 메틸화를 검출함으로써, 전암병변 진단을 위한 정보를 주는 방법을 제공하는 효과가 있다. 아울러, 본 발명에 따른 메틸화 검출방법과 검출용 키트를 이용하면, 장암을 초기 형질전환단계에서 진단할 수 있어 조기 진단이 가능하고, 통상적인 방법보다 정확하고 빠르게 전암병변을 진단할 수 있어 유용하다.

    SDC2(Syndecan 2) 유전자의 메틸화 검출방법

    公开(公告)号:WO2018194280A1

    公开(公告)日:2018-10-25

    申请号:PCT/KR2018/003415

    申请日:2018-03-23

    Inventor: 안성환 오태정

    CPC classification number: C12Q1/6886

    Abstract: 본 발명은 SDC2(Syndecan 2) 유전자 CpG 섬 부위의 메틸화를 검출하는 방법, SDC2 유전자 CpG 섬 부위의 메틸화 검출용 조성물, 및 SDC2 유전자 CpG 섬 부위의 메틸화 검출용 키트에 관한 것으로, 보다 구체적으로는 메틸화된 SDC2 DNA에 상보적으로 결합하고 하나 이상의 CG 또는 GC를 포함하는 정방향 및/또는 역방향 프라이머를 사용하여 메틸화된 SDC2 DNA를 증폭하여 SDC2 유전자 CpG 섬 부위의 메틸화를 검출하는 방법, 상기 프라이머를 포함하는 SDC2 유전자 CpG 섬 부위의 메틸화 검출용 조성물, 및 상기 프라이머를 포함하는 SDC2 유전자 CpG 섬 부위의 메틸화 검출용 키트에 관한 것이다.

    염기 특이 반응성 프라이머를 이용한 핵산 증폭방법
    4.
    发明申请
    염기 특이 반응성 프라이머를 이용한 핵산 증폭방법 审中-公开
    使用特异性反应引物的核酸扩增方法

    公开(公告)号:WO2014163225A1

    公开(公告)日:2014-10-09

    申请号:PCT/KR2013/003185

    申请日:2013-04-16

    Inventor: 안성환 오태정

    CPC classification number: C12Q1/6858 C12Q2521/101 C12Q2523/125

    Abstract: 본 발명은 기존의 염기 특이 반응성 PCR(allele-specific PCR)의 문제점을 해결하기 위하여 고안된 염기 특이 반응성 프라이머(Allele-specific reactive primer; ASRP)를 이용한 핵산 증폭방법에 관한 것으로, 더욱 자세하게는, 교정활성(proofreading)을 가지는 DNA 중합효소(DNA polymerase) 및 표적핵산과 상보적인 염기서열을 포함하고, 3' 말단에 비상보적 염기가 존재할 때 상기 DNA 중합효소의 교정활성에 의해 잘려나가는 염기의 5' 방향으로 바로 앞쪽의 염기부터 5' 말단까지의 염기 중의 하나 이상이 중합반응의 시발체로 작용할 수 없도록 변형된 염기 특이 반응성 프라이머 (Allele-specific reactive primer; ASRP)의 존재하에 표적핵산을 증폭시키는 것을 특징으로 하는 표적핵산의 검출방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 대립형질 특이반응성 프라이머를 이용한 검출방법은 ASRP 및 교정반응 DNA 중합효소의 특성상 증폭의 특이도가 매우 높은 기술로서, 단일염기다형성(SNP; Single Nucletide Polymorphism)를 포함하는 돌연변이(점돌연변이, 삽입, 결실)를 효과적으로 검출할 수 있으며, 바이설파이트(bisulfate) 처리 후 CpG 메틸화 유무를 검출하거나, DNA 라이브러리에서 원하는 염기서열로 시작되는 목적 DNA를 증폭하여 검출하는데도 활용할 수 있다.

    Abstract translation: 本发明涉及使用等位基因特异性反应性引物(ASRP)的核酸扩增方法,其被设计用于解决常规等位基因特异性PCR的问题。 更具体地,本发明涉及靶核酸的检测方法,其包含具有校正活性的DNA聚合酶和与靶核酸互补的碱基序列,其中靶核酸在ASRP的存在下被扩增, 以这样一种方式进行修饰,即当碱基不存在于3位时被DNA聚合酶的校正活性切断的碱的5'端方向的碱基的一个或多个碱基 '结束,在5'端的碱基,不能作为聚合的底漆。 使用根据本发明的ASRP的检测方法是由于ASRP和校对DNA聚合酶的特征而具有非常高的扩增特异性的技术,并且能够有效地检测突变(点突变,插入和缺失),包括 单核苷酸多态性(SNP)。 此外,该方法还可用于检测亚硫酸氢盐处理后CpG甲基化的存在,或用于从DNA文库以所需碱基序列开始扩增和检测靶DNA。

    위용종 및 위암 특이적 메틸화 마커 유전자를 이용한 위용종 및 위암의 검출방법
    5.
    发明申请
    위용종 및 위암 특이적 메틸화 마커 유전자를 이용한 위용종 및 위암의 검출방법 审中-公开
    检测胃肠道多糖和胃癌的方法,使用标记多态性和胃癌特异性甲基化标记基因

    公开(公告)号:WO2014073785A1

    公开(公告)日:2014-05-15

    申请号:PCT/KR2013/008623

    申请日:2013-09-26

    Inventor: 안성환 오태정

    CPC classification number: C12Q1/6886 C12Q2600/154

    Abstract: 본 발명은 SDC2 (NM_002998, 신데칸 2, Syndecan 2) 유전자의 위용종 및 위암 특이적 메틸화 바이오마커로서의 새로운 용도에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 를 바이오마커로 이용하여 메틸화 정도를 측정함으로써 위용종 및 위암을 조기에 진단하는 용도에 관한 것이다. 본 발명은 위용종 및 위암 특이적 마커 유전자의 CpG 섬의 메틸화를 검출함으로써, 위암 진단을 위한 정보를 주는 방법을 제공하는 효과가 있다. 아울러, 본 발명에 따른 메틸화 검출방법과 진단용 조성물, 키트 및 핵산 칩을 이용하면, 위암을 초기 형질전환단계에서 진단할 수 있어 조기 진단이 가능하고, 통상적인 방법보다 정확하고 빠르게 위암을 진단할 수 있어 유용하다.

    Abstract translation: 本发明涉及SDC2(NM_002998,syndecan 2)基因作为胃息肉和胃癌特异性甲基化的生物标志物的新用途,更具体地涉及早期诊断胃息肉和胃癌的用途 通过使用SDC2基因作为生物标志物测量甲基化水平。 本发明具有通过检测胃息肉的CpG岛和胃癌特异性标记基因的甲基化来提供可以提供胃癌诊断信息的方法。 此外,使用本发明的甲基化检测方法和用于诊断的组合物,试剂盒和核酸芯片,可以在初始转化阶段诊断胃癌,从而可以实现早期诊断。 因此,本发明是有用的,因为可以比常规方法更准确和快速地诊断胃癌。

    대장암 검출 방법
    6.
    发明申请

    公开(公告)号:WO2021091239A1

    公开(公告)日:2021-05-14

    申请号:PCT/KR2020/015360

    申请日:2020-11-05

    Inventor: 안성환 오태정

    Abstract: 본 발명은 대장암 진단에 정보를 제공하는 방법, 대장암 진단용 조성물 및 이를 포함하는 키트에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 메틸화된 복수의 대장암 마커 유전자를 특이적으로 증폭하는 프라이머를 이용하여, 대장암 진단에 정보를 제공하는 방법, 대장암 진단용 조성물 및 이를 포함하는 키트에 관한 것이다.

    메틸화 DNA 다중 검출방법
    7.
    发明申请
    메틸화 DNA 다중 검출방법 审中-公开
    甲基化DNA多重检测方法

    公开(公告)号:WO2018066910A1

    公开(公告)日:2018-04-12

    申请号:PCT/KR2017/010907

    申请日:2017-09-29

    Inventor: 안성환 오태정

    Abstract: 본 발명은 타겟 DNA의 메틸화를 다중으로 검출하는 방법 및 타겟 DNA의 메틸화 검출을 위한 조성물에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 타겟 DNA와 상보적으로 결합할 수 있는 타겟 특이적 서열 및 타겟 DNA에 상보적으로 결합하지 않는 유니버셜 프라이머를 포함하는 올리고뉴클레오타이드를 제작하여, 이를 프라이머로 사용함으로써 타겟 DNA를 선형 증폭하고, 선형 증폭된 타겟 DNA를 선형 증폭된 DNA에 상보적으로 결합할 수 있는 올리고뉴클레오타이드, 유니버셜 프라이머 및 프로브를 이용하여 증폭함으로써, 타겟 DNA의 메틸화를 검출하는 방법에 관한 것이다.

    Abstract translation:

    本发明具体地针对能够结合,并且更具体地涉及一种靶DNA和互补的对于该方法的甲基化检测和用于检测在多个靶DNA的甲基化的靶DNA的组合物 含有通用引物的序列和寡核苷酸不结合到互补于靶DNA产生的核苷酸,将它们结合起来线性扩增靶DNA通过使用的引物,和以线性扩增DNA互补一个线性放大的靶DNA 并且通过使用寡核苷酸,通用引物和可以使用的探针进行扩增来检测靶DNA的甲基化。

    전암병변의 검출방법
    8.
    发明申请
    전암병변의 검출방법 审中-公开
    检测前列腺炎的方法

    公开(公告)号:WO2015023146A1

    公开(公告)日:2015-02-19

    申请号:PCT/KR2014/007582

    申请日:2014-08-14

    Inventor: 안성환 오태정

    CPC classification number: C12Q1/6886 C12Q2600/112 C12Q2600/118 C12Q2600/154

    Abstract: 본 발명은 SDC2 (NM_002998, 신데칸 2, Syndecan 2) 유전자의 전암병변 검출용 메틸화 바이오마커로서의 새로운 용도에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 이를 바이오마커로 이용하여 메틸화 정도를 측정함으로써 대장 내 전암병변을 조기에 진단하는 용도에 관한 것이다. 본 발명은 대장 내 전암병변을 신데칸 2 유전자의 CpG 메틸화를 검출함으로써, 전암병변 진단을 위한 정보를 주는 방법을 제공하는 효과가 있다. 아울러, 본 발명에 따른 메틸화 검출방법과 검출용 키트를 이용하면, 장암을 초기 형질전환단계에서 진단할 수 있어 조기 진단이 가능하고, 통상적인 방법보다 정확하고 빠르게 전암병변을 진단할 수 있어 유용하다.

    Abstract translation: 本发明涉及SDC2(NM_002998,syndecan 2)基因作为检测癌前病变的甲基化生物标志物的新用途,更具体地,涉及用于通过测量大肠中早期诊断大肠癌前病变的用途 甲基化水平使用SDC2基因作为生物标志物。 本发明具有通过检测大肠癌前病变的syndecan 2基因的CpG甲基化来提供用于诊断癌前病变的信息的方法。 此外,使用本发明的甲基化检测方法和检测用试剂盒,可以在初始转化阶段诊断肠癌,从而可以进行早期诊断。 此外,本发明是有用的,因为可以比常规方法更准确和快速地诊断癌前病变。

    폐암특이적 메틸화 마커 유전자를 이용한 폐암 검출방법
    9.
    发明申请
    폐암특이적 메틸화 마커 유전자를 이용한 폐암 검출방법 审中-公开
    使用肺癌特异性甲基标记基因的肺癌检测方法

    公开(公告)号:WO2009113771A1

    公开(公告)日:2009-09-17

    申请号:PCT/KR2009/000777

    申请日:2009-02-18

    CPC classification number: C12Q1/6886 C12Q2600/112 C12Q2600/154 C12Q2600/156

    Abstract: 본 발명은 폐암 특이적인 바이오마커를 이용한 폐암의 검출방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로는, 폐암 형질전환 세포에서 5'UTR 또는 엑손 1 부위가 특이적으로 메틸화되는 PCDHGA12 유전자의 메틸화를 확인할 수 폐암 진단용 바이오마커 및 상기 바이오마커를 이용한 폐암의 검출방법에 관한 것이다. 본 발명의 진단용 키트를 이용하면, 통상적인 방법보다 정확하고 빠르게 폐암의 조기 진단이 가능하며, 폐암 및 그 진행단계의 예후예측 및 모니터링에 응용할 수 있다.

    Abstract translation: 本发明涉及使用肺癌特异性生物标志物的肺癌检测方法,更具体地,涉及能够检测PCDHGA12基因的甲基化的肺癌的生物标志物,其中5'UTR或外显子1部分在细胞中 转化为肺癌细胞是特异性甲基化的,以及使用该生物标志物的肺癌检测方法。 与常规方法相比,本发明的诊断试剂盒允许以快速和准确的方式进行肺癌的早期诊断。 本发明的诊断试剂盒可用于肺癌的早期诊断和监测及其进展。

    SDC2 유전자의 메틸화 검출방법
    10.
    发明申请

    公开(公告)号:WO2020256293A1

    公开(公告)日:2020-12-24

    申请号:PCT/KR2020/006692

    申请日:2020-05-22

    Inventor: 안성환 오태정

    Abstract: 본 발명은 SDC2 유전자의 메틸화를 검출하는 방법, SDC2 유전자의 메틸화 검출을 위한 조성물 및 이를 포함하는 키트에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 메틸화된 SDC2 유전자를 특이적으로 증폭하는 프라이머 및 프라이머에 의해 특이적으로 증폭된 메틸화된 SDC2 유전자에 상보적으로 혼성화 할 수 있는 프로브를 이용하여, SDC2 유전자의 메틸화를 검출하는 방법, SDC2 유전자의 메틸화 검출을 위한 조성물 및 이를 포함하는 키트에 관한 것이다.

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