Abstract:
본 발명은 유방암 진단을 위한 유방암 특이적 메틸화 마커 유전자의 메틸화 검출방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로는 유방암 세포에서 특이적으로 메틸화되는 유방암 특이적 마커 유전자의 메틸화를 검출하여 유방암 또는 그 진행단계 진단을 위한 정보를 제공하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 메틸화 검출방법과 진단용 조성물, 키트 및 핵산 칩을 이용하면, 통상적인 방법보다 정확하고 빠르게 유방암의 조기 진단이 가능하고 또한 유방암 진행단계의 확인이 가능할 뿐만 아니라, 비침습적 시료인 혈청을 샘플로 이용할 수 있어 보다 간편하고 정확하게 유방암을 진단할 수 있어 유용하다.
Abstract:
본 발명은 SDC2 (NM_002998, 신데칸 2, Syndecan 2) 유전자의 전암병변 검출용 메틸화 바이오마커로서의 새로운 용도에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 이를 바이오마커로 이용하여 메틸화 정도를 측정함으로써 대장 내 전암병변을 조기에 진단하는 용도에 관한 것이다. 본 발명은 대장 내 전암병변을 신데칸 2 유전자의 CpG 메틸화를 검출함으로써, 전암병변 진단을 위한 정보를 주는 방법을 제공하는 효과가 있다. 아울러, 본 발명에 따른 메틸화 검출방법과 검출용 키트를 이용하면, 장암을 초기 형질전환단계에서 진단할 수 있어 조기 진단이 가능하고, 통상적인 방법보다 정확하고 빠르게 전암병변을 진단할 수 있어 유용하다.
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본 발명은 SDC2(Syndecan 2) 유전자 CpG 섬 부위의 메틸화를 검출하는 방법, SDC2 유전자 CpG 섬 부위의 메틸화 검출용 조성물, 및 SDC2 유전자 CpG 섬 부위의 메틸화 검출용 키트에 관한 것으로, 보다 구체적으로는 메틸화된 SDC2 DNA에 상보적으로 결합하고 하나 이상의 CG 또는 GC를 포함하는 정방향 및/또는 역방향 프라이머를 사용하여 메틸화된 SDC2 DNA를 증폭하여 SDC2 유전자 CpG 섬 부위의 메틸화를 검출하는 방법, 상기 프라이머를 포함하는 SDC2 유전자 CpG 섬 부위의 메틸화 검출용 조성물, 및 상기 프라이머를 포함하는 SDC2 유전자 CpG 섬 부위의 메틸화 검출용 키트에 관한 것이다.
Abstract:
본 발명은 기존의 염기 특이 반응성 PCR(allele-specific PCR)의 문제점을 해결하기 위하여 고안된 염기 특이 반응성 프라이머(Allele-specific reactive primer; ASRP)를 이용한 핵산 증폭방법에 관한 것으로, 더욱 자세하게는, 교정활성(proofreading)을 가지는 DNA 중합효소(DNA polymerase) 및 표적핵산과 상보적인 염기서열을 포함하고, 3' 말단에 비상보적 염기가 존재할 때 상기 DNA 중합효소의 교정활성에 의해 잘려나가는 염기의 5' 방향으로 바로 앞쪽의 염기부터 5' 말단까지의 염기 중의 하나 이상이 중합반응의 시발체로 작용할 수 없도록 변형된 염기 특이 반응성 프라이머 (Allele-specific reactive primer; ASRP)의 존재하에 표적핵산을 증폭시키는 것을 특징으로 하는 표적핵산의 검출방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 대립형질 특이반응성 프라이머를 이용한 검출방법은 ASRP 및 교정반응 DNA 중합효소의 특성상 증폭의 특이도가 매우 높은 기술로서, 단일염기다형성(SNP; Single Nucletide Polymorphism)를 포함하는 돌연변이(점돌연변이, 삽입, 결실)를 효과적으로 검출할 수 있으며, 바이설파이트(bisulfate) 처리 후 CpG 메틸화 유무를 검출하거나, DNA 라이브러리에서 원하는 염기서열로 시작되는 목적 DNA를 증폭하여 검출하는데도 활용할 수 있다.
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본 발명은 SDC2 (NM_002998, 신데칸 2, Syndecan 2) 유전자의 위용종 및 위암 특이적 메틸화 바이오마커로서의 새로운 용도에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 를 바이오마커로 이용하여 메틸화 정도를 측정함으로써 위용종 및 위암을 조기에 진단하는 용도에 관한 것이다. 본 발명은 위용종 및 위암 특이적 마커 유전자의 CpG 섬의 메틸화를 검출함으로써, 위암 진단을 위한 정보를 주는 방법을 제공하는 효과가 있다. 아울러, 본 발명에 따른 메틸화 검출방법과 진단용 조성물, 키트 및 핵산 칩을 이용하면, 위암을 초기 형질전환단계에서 진단할 수 있어 조기 진단이 가능하고, 통상적인 방법보다 정확하고 빠르게 위암을 진단할 수 있어 유용하다.
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본 발명은 대장암 진단에 정보를 제공하는 방법, 대장암 진단용 조성물 및 이를 포함하는 키트에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 메틸화된 복수의 대장암 마커 유전자를 특이적으로 증폭하는 프라이머를 이용하여, 대장암 진단에 정보를 제공하는 방법, 대장암 진단용 조성물 및 이를 포함하는 키트에 관한 것이다.
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본 발명은 타겟 DNA의 메틸화를 다중으로 검출하는 방법 및 타겟 DNA의 메틸화 검출을 위한 조성물에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 타겟 DNA와 상보적으로 결합할 수 있는 타겟 특이적 서열 및 타겟 DNA에 상보적으로 결합하지 않는 유니버셜 프라이머를 포함하는 올리고뉴클레오타이드를 제작하여, 이를 프라이머로 사용함으로써 타겟 DNA를 선형 증폭하고, 선형 증폭된 타겟 DNA를 선형 증폭된 DNA에 상보적으로 결합할 수 있는 올리고뉴클레오타이드, 유니버셜 프라이머 및 프로브를 이용하여 증폭함으로써, 타겟 DNA의 메틸화를 검출하는 방법에 관한 것이다.
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본 발명은 SDC2 (NM_002998, 신데칸 2, Syndecan 2) 유전자의 전암병변 검출용 메틸화 바이오마커로서의 새로운 용도에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 이를 바이오마커로 이용하여 메틸화 정도를 측정함으로써 대장 내 전암병변을 조기에 진단하는 용도에 관한 것이다. 본 발명은 대장 내 전암병변을 신데칸 2 유전자의 CpG 메틸화를 검출함으로써, 전암병변 진단을 위한 정보를 주는 방법을 제공하는 효과가 있다. 아울러, 본 발명에 따른 메틸화 검출방법과 검출용 키트를 이용하면, 장암을 초기 형질전환단계에서 진단할 수 있어 조기 진단이 가능하고, 통상적인 방법보다 정확하고 빠르게 전암병변을 진단할 수 있어 유용하다.
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본 발명은 폐암 특이적인 바이오마커를 이용한 폐암의 검출방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로는, 폐암 형질전환 세포에서 5'UTR 또는 엑손 1 부위가 특이적으로 메틸화되는 PCDHGA12 유전자의 메틸화를 확인할 수 폐암 진단용 바이오마커 및 상기 바이오마커를 이용한 폐암의 검출방법에 관한 것이다. 본 발명의 진단용 키트를 이용하면, 통상적인 방법보다 정확하고 빠르게 폐암의 조기 진단이 가능하며, 폐암 및 그 진행단계의 예후예측 및 모니터링에 응용할 수 있다.
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본 발명은 SDC2 유전자의 메틸화를 검출하는 방법, SDC2 유전자의 메틸화 검출을 위한 조성물 및 이를 포함하는 키트에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 메틸화된 SDC2 유전자를 특이적으로 증폭하는 프라이머 및 프라이머에 의해 특이적으로 증폭된 메틸화된 SDC2 유전자에 상보적으로 혼성화 할 수 있는 프로브를 이용하여, SDC2 유전자의 메틸화를 검출하는 방법, SDC2 유전자의 메틸화 검출을 위한 조성물 및 이를 포함하는 키트에 관한 것이다.