公开(公告)号：CN115948521B

公开(公告)日：2024-06-25

申请号：CN202211716471.3

申请日：2022-12-29

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 陈肃 ,  陈嵩 ,  于越 ,  王鑫宇 ,  周妍 ,  何蕊含 ,  刘文轩 ,  刘宣晨

IPC: C12Q1/6869 ,  G16B40/20

Abstract: 本发明公开了一种检测非整倍体缺失染色体信息的方法，包括以下步骤：提取待测生物体的DNA并进行全基因组测序，获得测序序列；将所述测序序列比对至参考基因组上，并获取待测生物体的每条染色体的频率散点图；将所述每条染色体的频率散点图进行拟合，并获取拟合曲线中所有高斯峰对应的测序深度；对所述测序深度进行聚类处理，进而获得待测生物体的染色体倍性。本发明以二代高通量测序技术为基础，在面对大批量的样品时，相较于传统检测方法可大大缩短时间，同时可实现自动化操作，具有标准性和可重复性等优势。

公开(公告)号：CN115948521A

公开(公告)日：2023-04-11

申请号：CN202211716471.3

申请日：2022-12-29

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 陈肃 ,  陈嵩 ,  于越 ,  王鑫宇 ,  周妍 ,  何蕊含 ,  刘文轩 ,  刘宣晨

IPC: C12Q1/6869 ,  G16B40/20

Abstract: 本发明公开了一种检测非整倍体缺失染色体信息的方法，包括以下步骤：提取待测生物体的DNA并进行全基因组测序，获得测序序列；将所述测序序列比对至参考基因组上，并获取待测生物体的每条染色体的频率散点图；将所述每条染色体的频率散点图进行拟合，并获取拟合曲线中所有高斯峰对应的测序深度；对所述测序深度进行聚类处理，进而获得待测生物体的染色体倍性。本发明以二代高通量测序技术为基础，在面对大批量的样品时，相较于传统检测方法可大大缩短时间，同时可实现自动化操作，具有标准性和可重复性等优势。

公开(公告)号：CN115404282A

公开(公告)日：2022-11-29

申请号：CN202211217471.9

申请日：2022-10-04

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 刘彩霞 ,  曲冠证 ,  陈肃 ,  王遂 ,  刘文轩 ,  樊二勤 ,  刘宇航

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开一种快速鉴定小黑杨纯合二倍体的方法。本发明基于小黑杨全基因组重测序的信息，筛选出可以鉴定小黑杨特定SNP位点的特异性引物，通过SNP分子标记技术和PCR技术相结合的方法，进行鉴定由小黑杨获得的纯合二倍体，其具有高效、精确、可重复性高的特点。相对于传统鉴定方法而言，本发明可在极短的时间内获得结果，大幅度减少工作时间和工作量，且实验结果也更加真实可靠。本发明属于首次建立了高效的小黑杨纯合二倍体鉴定方法，可为其他杨树的单倍体育种提供有价值的参考。