公开(公告)号：CN118146334A

公开(公告)日：2024-06-07

申请号：CN202211561433.5

申请日：2022-12-07

Applicant: 北京大学

Inventor： 张文彬 ,  曲志宇

IPC: C07K14/435 ,  C07K19/00 ,  C12N15/70

Abstract: 本发明公开了一种单结构域荧光蛋白索烃及其构建和在制备融合蛋白索烃中的应用。本发明对荧光蛋白序列进行拆分和重组，结合蛋白质偶联反应对，通过组装‑反应协同的策略实现了单结构域荧光蛋白索烃以及融合蛋白索烃的制备。本发明的方法能够提升蛋白质的热稳定性、机械稳定性以及重折叠能力，可用于探究拓扑重构对于蛋白质构效关系的影响。

公开(公告)号：CN118155706A

公开(公告)日：2024-06-07

申请号：CN202211565469.0

申请日：2022-12-07

Applicant: 北京大学

Inventor： 张文彬 ,  吴文豪 ,  王宇翔 ,  方晶 ,  曲志宇

IPC: G16B15/00 ,  G16B15/20

Abstract: 本发明公开了一种拓扑蛋白质的程序化设计方法，所述方法包括以下步骤：i)对目标蛋白质原有结构进行拆分，根据目标拓扑结构设计可能的重新连接方式；ii)对结构基元间的连接方式进行评价，确定其在后续设计中的优先级；iii)针对每种连接方式，依次生成新的虚拟环区，遍历所有可能的环区生成顺序组合，产生相应的空间关系，判断所形成的化学拓扑结构，计算目标拓扑结构的形成概率，并确定新生成的环区长度范围；iv)设计拓扑蛋白质新生成的环区的长度和序列。本发明提供的拓扑蛋白质的程序化设计方法为阐明拓扑蛋白质的构效关系提供了理想的平台，也为开发拓扑功能蛋白质提供了便捷的方法。