公开(公告)号：CN115223659A

公开(公告)日：2022-10-21

申请号：CN202210934654.6

申请日：2022-08-04

Applicant: 华东交通大学

Inventor： 张伟 ,  徐亚新 ,  郑晓颖 ,  蔡娴娴

IPC: G16B30/10 ,  G06K9/62 ,  G06F17/16

Abstract: 本申请涉及一种基于低秩表征和改进谱聚类的单细胞RNA测序数据聚类方法，它包括如下步骤：基于单细胞RNA测序数据矩阵，建立联合低秩表示和自适应图正则化的数学模型；采用交替方向乘子法，构建增广拉格朗日函数，对每个变量进行单独优化，得到细胞与细胞间相似性矩阵S；采用谱聚类方法对相似性矩阵S进行聚类，得到对单细胞的分类。本发明可有效的将低秩表征来刻画数据全局结构，结合谱聚类模型将数据非线性关联特征自适应的结合起来建立优化模型，并且实现对单细胞的细胞类型分类；实验数值实验结果表明，本发明可以对单细胞RNA测序数据进行有效聚类。

公开(公告)号：CN115116551A

公开(公告)日：2022-09-27

申请号：CN202210743745.1

申请日：2022-06-27

Applicant: 华东交通大学

Inventor： 张伟 ,  蔡娴娴 ,  徐亚新

IPC: G16B50/30 ,  G16B5/00

Abstract: 本发明公开了一种基于非负矩阵分解框架的预测蛋白质相互作用关系的计算方法。该方法有效融合蛋白质相互作用数据的拓扑结构特征以及蛋白质的本体语义相似度信息；将这两种信息融入非负矩阵分解方法框架中，通过迭代求解非负矩阵分解的结果，得到蛋白质之间连接关系相似度矩阵；最后通过亚细胞定位信息矩阵进行过滤，得到未知连接关系的蛋白质之间相似度值，相似度越大，意味着这两个蛋白质之间存在相互作用的可能性越大。经测试验证，本发明提出的方法可以显著提高预测未知蛋白质相互作用关系的精度和效率。