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公开(公告)号：CN113151500B
公开(公告)日：2024-07-23
申请号：CN202110481747.3
申请日：2021-04-30
Applicant: 南京大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6844 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种淡水珍稀哺乳动物—长江江豚在淡水环境中快速检测方法，属于生物技术领域。本发明首先基于我国长江江豚全线粒体组设计了1对等温扩增引物和探针，该引物具有特异性好、稳定性高的特点，等温PCR扩增中成功率高，可以很好对长江江豚DNA进行PCR扩增，可广泛应用于长江江豚DNA的快速检测以及物种保护等研究中。本发明还配合环境DNA技术以及恒温扩增PCR技术，提供了针对长江江豚基因快速检测的试剂盒，无需经过测序，通过核酸检测试纸条可得知阳性或阴性结果，成本低，操作简便，耗时10‑20分钟，能快速准确的对淡水环境中长江江豚基因进行检测。
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公开(公告)号：CN113393131A
公开(公告)日：2021-09-14
申请号：CN202110675797.5
申请日：2021-06-18
Applicant: 南京大学
IPC: G06Q10/06 , C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种基于环境DNA宏条形码监测数据，对淡水生态系统的浮游植物进行生物完整性评价的方法，属于生物技术领域。本发明基于环境DNA宏条形码监测浮游植物的结果，设计了包含(1)参考点和受损点确定；(2)环境DNA样品采集；(3)eDNA宏条形码生物监测；(4)基于eDNA宏条形码监测的候选生物指标定义及计算；(5)候选指数筛选；(6)选定生物指标计算浮游植物生物完整性得分；(7)划分健康等级等一系列监测与评价流程，为淡水浮游植物的生态完整性评价提供了完整且易于操作的指导，可广泛应用于溪流、河流、湖泊和水库等淡水生态系统的浮游植物完整性评价和水生态健康状况评估。
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公开(公告)号：CN104404154B
公开(公告)日：2018-01-09
申请号：CN201410736863.5
申请日：2014-12-05
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种浮游动物rrnL基因扩增引物及其筛选方法和应用及应用方法，属于生物技术领域。本发明依据常见浮游动物rrnL基因序列设计了9条PCR扩增引物，包括5条上游引物和4条下游引物，该引物对浮游动物覆盖度广、扩增效率高，其PCR产物兼容高通量测序平台，将上游引物和下游引物两两组合可以扩增出长度为190bp至390bp的产物，这种多引物组合的方法可以降低非特异性扩增，提高PCR成功率，可广泛用作Barcode序列进行物种鉴定、生物多样性分析等研究。
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公开(公告)号：CN104404154A
公开(公告)日：2015-03-11
申请号：CN201410736863.5
申请日：2014-12-05
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种浮游动物rrnL基因扩增引物及其筛选方法和应用及应用方法，属于生物技术领域。本发明依据常见浮游动物rrnL基因序列设计了9条PCR扩增引物，包括5条上游引物和4条下游引物，该引物对浮游动物覆盖度广、扩增效率高，其PCR产物兼容高通量测序平台，将上游引物和下游引物两两组合可以扩增出长度为190bp至390bp的产物，这种多引物组合的方法可以降低非特异性扩增，提高PCR成功率，可广泛用作Barcode序列进行物种鉴定、生物多样性分析等研究。
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公开(公告)号：CN117275606A
公开(公告)日：2023-12-22
申请号：CN202311254921.6
申请日：2023-09-26
Applicant: 南京大学
IPC: G16C20/30 , G16C20/70 , G06F18/241 , G06F18/213
Abstract: 本发明公开了一种基于化合物2D结构的用途分类模型的构建方法与应用，属于化合物用途高通量预测领域。本发明通过CompTox Chemicals Dashboard数据库收集化合物结构和用途，将化合物结构用分子描述符和混合分子指纹表征，而后去冗余并输入随机森林回归模型进行特征选择、超参数搜索、模型训练和验证，通过化合物的结构实现有效预测化合物的用途，有效填补目前大量化学品仅有结构而用途未知的空白，为我国和全球化学品的管控提供有效辅助和导向。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN116189762A
公开(公告)日：2023-05-30
申请号：CN202310189155.3
申请日：2023-02-28
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种基于斑马鱼胚胎体系的内分泌简化转录组的构建方法与应用，属于内分泌干扰物高通量识别和筛查领域。本发明通过使用BORDA计数法整合了基因中心性、信息丰富度和冗余程度三个维度的证据得分，构建了特异性的内分泌干扰简化基因集，极大的减少了每个物质内分泌干扰筛查所需的测序深度，在降低测试成本的同时提高对内分泌干扰物的筛查通量，对我国和全球内分泌干扰相关新污染物的快速筛查、机制解析和有害结局的预测提供助力和支撑。
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公开(公告)号：CN110415770A
公开(公告)日：2019-11-05
申请号：CN201910788995.5
申请日：2019-08-26
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种基于剂量-效应简化转录组预测化学品胚胎发育毒性的计算方法，属于预测毒理学领域。本发明通过系统地整合高通量测试数据进行打分计算，来预测化学品胚胎毒性，并识别化学品的关键毒性机制。本发明的计算方法以关键事件(KE)间相关证据为依据，利用剂量-效应简化转录组等高通量分子测试数据对斑马鱼发育相关的有害结局路径(AOP)进行激活打分计算。本发明比传统的胚胎发育毒性测试更加高效、更加敏感，实现了高效的基于化学品致毒机制的毒性预测，可以通过低剂量化学品对早期胚胎转录水平的影响来预测更长生命阶段的发育毒性效应，识别化学品的致毒机制，区分不同致毒模式的化学品。
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公开(公告)号：CN107884507B
公开(公告)日：2019-05-21
申请号：CN201711457584.5
申请日：2017-12-28
Applicant: 南京大学
IPC: G01N30/88
Abstract: 本专利公开了一种同时快速筛查废水中农药、药物及其转化产物的方法，属于分析化学领域。所述方法步骤为：a)、分析检测：对样品进行分析检测；b)、农药、药物鉴定：采用农药药物数据库软件进行筛查，鉴定存在的农药、药物；c)、转化产物鉴定‑非靶向筛查步骤：通过软件对步骤b)中已经鉴定的农药、药物进行转化产物预测，针对于农药药物的母体化合物进行二级谱图解析、化合物筛选，预测出诊断离子，对所有含有诊断离子的化合物提取相应的色谱峰进行转化产物的分析鉴定。利用本发明的方法能够实现废水中农药，药物及其转化产物的同时筛查，筛查速度快、范围广、准确度高。
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公开(公告)号：CN104404160B
公开(公告)日：2018-10-09
申请号：CN201410748206.2
申请日：2014-12-09
Applicant: 南京大学
IPC: C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12N15/10 , G06F19/28
Abstract: 本发明公开了一种利用高通量测序构建浮游动物条形码数据库的方法，属于生物技术领域。本发明设计的MIT引物由测序接头序列、8‑12个碱基的barcode序列和常规PCR引物组成；本发明中利用高通量测序构建浮游动物条形码数据库的方法包括：单个体裂解法提取DNA、线粒体DNA(MIT)引物PCR扩增、PCR扩增产物纯化及定量、高通量测序和序列分析，本方法采用特殊的MIT引物，避免了测序文库的构建，通过高通量测序可一次性的获得大量的条形码序列，操作方便，快速，经济，便于推广应用，能高效的构建各种动物条形码数据库。
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公开(公告)号：CN105259325A
公开(公告)日：2016-01-20
申请号：CN201510780823.5
申请日：2015-11-13
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种污水生物毒性在线监测预警装置，该装置由控制单元、支架、进样单元、培养单元和检测单元组成。本发明公开的装置在采用美国EPA稀释倍数生物毒性表征方法的基础上，排除了水温不适宜等可能影响鱼类正常生存的因素的干扰；采用自动控制原理，通过多种比例试样混合的综合评价，可分别计算每个试样的TU值，将所有监测的TU值平均数作为最终TU值，使得检测结果更准确；采用在线性轨迹跟踪分析成像技术，如监测过程中鱼类轨迹突然发生异常变化，则自动触发报警装置，提醒工作人员迅速赶往现场进行应急处理，此举有效降低了人员长时间现场关注的工作量。
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