一种基于纳米孔靶向测序技术检测RNF180基因启动子甲基化的方法及检测试剂盒

    公开(公告)号:CN118360401A

    公开(公告)日:2024-07-19

    申请号:CN202410595908.5

    申请日:2024-05-14

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种基于纳米孔靶向测序技术检测RNF180基因启动子甲基化的方法及检测试剂盒,属于分子医学技术领域。通过将纳米孔长读长测序技术和Cas9体外切割技术进行结合来检测RNF180基因启动子甲基化位点的甲基化状态,针对RNF180启动子区域设计四条Cas9靶向切割RNF180基因启动子的crRNA间隔序列,在目标区域上下游各切割两次,包含RNF180启动子区域及其侧翼区域。本方法检测甲基化位点不需要经过重亚硫酸盐处理样本,可以快速高效的获得样本DNA最原始的甲基化状态,既可以从整体水平评估甲基化水平还可以获得单个甲基化位点的甲基化状态。可为肿瘤的早期筛查、风险评估、诊断、预后判断及治疗监测的依据。

    一种基于纳米孔靶向测序技术检测TFPI2基因启动子甲基化的方法及检测试剂盒

    公开(公告)号:CN118291472A

    公开(公告)日:2024-07-05

    申请号:CN202410595613.8

    申请日:2024-05-14

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种基于纳米孔靶向测序技术检测TFPI2基因启动子甲基化的方法及检测试剂盒,属于分子医学技术领域。通过将纳米孔长读长测序技术和Cas9体外切割技术进行结合来检测TFPI2基因启动子甲基化位点的甲基化状态,针对TFPI2启动子区域设计四条Cas9靶向切割TFPI2基因启动子的crRNA间隔序列,在目标区域上下游各切割两次,包含TFPI2启动子区域及其侧翼区域。方法检测甲基化位点不需要经过重亚硫酸盐处理样本,可以快速高效的获得样本靶标DNA最原始的甲基化状态,既可以从整体水平评估甲基化水平还可以获得单个甲基化位点的甲基化状态。

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