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公开(公告)号:CN113488104B
公开(公告)日:2024-06-18
申请号:CN202110638436.3
申请日:2021-06-08
Applicant: 安徽大学
Abstract: 本发明公开了一种基于局部和全局的网络中心性分析的癌症驱动基因预测方法,包括以下步骤:S1:对标准化的体细胞突变数据和基因表达数据进行预处理,表达成基因‑矩阵的形式;S2:使用预处理完成的数据对下载的PPI网络加权;S3:模型构建,使用改进的重启随机游走算法分析网络的全局和局部特征;S4:使用构建好的模型对癌症数据集进行预测,以获取驱动基因的排名向量,实现对癌症驱动基因的预测。还公开了一种基于局部和全局的网络中心性分析的癌症驱动基因预测系统。本发明能够更好地识别驱动基因,大大提高对癌症驱动基因预测的精度,为癌症的诊断和精准医疗的发展做出了贡献。
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公开(公告)号:CN113488104A
公开(公告)日:2021-10-08
申请号:CN202110638436.3
申请日:2021-06-08
Applicant: 安徽大学
Abstract: 本发明公开了一种基于局部和全局的网络中心性分析的癌症驱动基因预测方法,包括以下步骤:S1:对标准化的体细胞突变数据和基因表达数据进行预处理,表达成基因‑矩阵的形式;S2:使用预处理完成的数据对下载的PPI网络加权;S3:模型构建,使用改进的重启随机游走算法分析网络的全局和局部特征;S4:使用构建好的模型对癌症数据集进行预测,以获取驱动基因的排名向量,实现对癌症驱动基因的预测。还公开了一种基于局部和全局的网络中心性分析的癌症驱动基因预测系统。本发明能够更好地识别驱动基因,大大提高对癌症驱动基因预测的精度,为癌症的诊断和精准医疗的发展做出了贡献。
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