浮游动物rrnL基因扩增引物及其筛选方法和应用及应用方法

    公开(公告)号:CN104404154A

    公开(公告)日:2015-03-11

    申请号:CN201410736863.5

    申请日:2014-12-05

    Applicant: 南京大学

    Inventor: 张效伟 杨江华

    Abstract: 本发明公开了一种浮游动物rrnL基因扩增引物及其筛选方法和应用及应用方法,属于生物技术领域。本发明依据常见浮游动物rrnL基因序列设计了9条PCR扩增引物,包括5条上游引物和4条下游引物,该引物对浮游动物覆盖度广、扩增效率高,其PCR产物兼容高通量测序平台,将上游引物和下游引物两两组合可以扩增出长度为190bp至390bp的产物,这种多引物组合的方法可以降低非特异性扩增,提高PCR成功率,可广泛用作Barcode序列进行物种鉴定、生物多样性分析等研究。

    一种利用高通量测序构建浮游动物条形码数据库的方法

    公开(公告)号:CN104404160B

    公开(公告)日:2018-10-09

    申请号:CN201410748206.2

    申请日:2014-12-09

    Applicant: 南京大学

    Inventor: 张效伟 杨江华

    Abstract: 本发明公开了一种利用高通量测序构建浮游动物条形码数据库的方法,属于生物技术领域。本发明设计的MIT引物由测序接头序列、8‑12个碱基的barcode序列和常规PCR引物组成;本发明中利用高通量测序构建浮游动物条形码数据库的方法包括:单个体裂解法提取DNA、线粒体DNA(MIT)引物PCR扩增、PCR扩增产物纯化及定量、高通量测序和序列分析,本方法采用特殊的MIT引物,避免了测序文库的构建,通过高通量测序可一次性的获得大量的条形码序列,操作方便,快速,经济,便于推广应用,能高效的构建各种动物条形码数据库。

    一种污水生物毒性在线监测预警装置

    公开(公告)号:CN105259325A

    公开(公告)日:2016-01-20

    申请号:CN201510780823.5

    申请日:2015-11-13

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种污水生物毒性在线监测预警装置,该装置由控制单元、支架、进样单元、培养单元和检测单元组成。本发明公开的装置在采用美国EPA稀释倍数生物毒性表征方法的基础上,排除了水温不适宜等可能影响鱼类正常生存的因素的干扰;采用自动控制原理,通过多种比例试样混合的综合评价,可分别计算每个试样的TU值,将所有监测的TU值平均数作为最终TU值,使得检测结果更准确;采用在线性轨迹跟踪分析成像技术,如监测过程中鱼类轨迹突然发生异常变化,则自动触发报警装置,提醒工作人员迅速赶往现场进行应急处理,此举有效降低了人员长时间现场关注的工作量。

    一种水体环境DNA智能采集装置及采集方法

    公开(公告)号:CN109406215B

    公开(公告)日:2024-02-09

    申请号:CN201811622098.9

    申请日:2018-12-28

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种水体环境DNA智能采集装置及采集方法,属于环境DNA检测技术领域。本发明所提供的水体环境DNA智能采集装置及采集方法,集智能控制、样品采集、残夜排空以及管路堵塞泄压保护功能于一体,既能进行水体生物样品的采集,又能进行水样采集,能有效的提高生物样品采样过程效率,滤水量计算准确性,保证了样品的时效性,使得检测水样的环境更接近自然环境;具有不易堵塞、结构简单、设计合理、易于制造的优点。(56)对比文件Yang, J 等.Ecogenomics of ZooplanktonCommunity Reveals Ecological Threshold ofAmmonia Nitrogen《.Environmental Science &Technology》.2017,第51卷(第5期),第3057–3064页.Ficetola, G. F. 等.Species detectionusing environmental DNA from watersamples《.Biology Letters》.2008,第4卷(第4期),第423–425页.付召军.一种水体环境DNA智能采集装置的系统设计《.科技风》.2020,(第9期),第41页.杨江华.太湖流域浮游动物物种多样性与环境污染群落生态效应研究《.中国博士学位论文全文数据库工程科技Ⅰ辑》.2018,(第3期),第B027-17页.姜维等.环境DNA分析技术——一种水生生物调查新方法《.水生态学杂志》.2016,第37卷(第5期),第1-7页.

    一种基于环境DNA宏条形码技术的底栖动物完整性评价方法

    公开(公告)号:CN113403400A

    公开(公告)日:2021-09-17

    申请号:CN202110675789.0

    申请日:2021-06-18

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于环境DNA宏条形码监测数据,对淡水生态系统的底栖动物进行生物完整性评价方法,属于生物技术领域。本发明基于环境DNA宏条形码监测底栖动物的结果,设计了包含(1)参考点和受损点确定;(2)环境DNA样品采集;(3)eDNA宏条形码生物监测;(4)基于eDNA宏条形码监测的候选生物指标定义及计算;(5)候选指数筛选;(6)选定生物指标计算底栖动物生物完整性得分,(7)划分健康等级等一系列监测与评价流程,为淡水底栖动物的生态完整性评价提供了完整且易于操作的指导,可广泛应用于溪流、河流、湖泊和水库等淡水生态系统的底栖动物完整性评价和水生态健康状况评估。

    一种基于环境DNA的长江江豚检测试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN113151500A

    公开(公告)日:2021-07-23

    申请号:CN202110481747.3

    申请日:2021-04-30

    Applicant: 南京大学

    Inventor: 杨江华 张效伟

    Abstract: 本发明公开了一种淡水珍稀哺乳动物—长江江豚在淡水环境中快速检测方法,属于生物技术领域。本发明首先基于我国长江江豚全线粒体组设计了1对等温扩增引物和探针,该引物具有特异性好、稳定性高的特点,等温PCR扩增中成功率高,可以很好对长江江豚DNA进行PCR扩增,可广泛应用于长江江豚DNA的快速检测以及物种保护等研究中。本发明还配合环境DNA技术以及恒温扩增PCR技术,提供了针对长江江豚基因快速检测的试剂盒,无需经过测序,通过核酸检测试纸条可得知阳性或阴性结果,成本低,操作简便,耗时10‑20分钟,能快速准确的对淡水环境中长江江豚基因进行检测。

    一种水体环境DNA智能采集装置及采集方法

    公开(公告)号:CN109406215A

    公开(公告)日:2019-03-01

    申请号:CN201811622098.9

    申请日:2018-12-28

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种水体环境DNA智能采集装置及采集方法,属于环境DNA检测技术领域。本发明所提供的水体环境DNA智能采集装置及采集方法,集智能控制、样品采集、残夜排空以及管路堵塞泄压保护功能于一体,既能进行水体生物样品的采集,又能进行水样采集,能有效的提高生物样品采样过程效率,滤水量计算准确性,保证了样品的时效性,使得检测水样的环境更接近自然环境;具有不易堵塞、结构简单、设计合理、易于制造的优点。

    一种污水生物毒性在线监测预警装置

    公开(公告)号:CN105259325B

    公开(公告)日:2017-03-22

    申请号:CN201510780823.5

    申请日:2015-11-13

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种污水生物毒性在线监测预警装置,该装置由控制单元、支架、进样单元、培养单元和检测单元组成。本发明公开的装置在采用美国EPA稀释倍数生物毒性表征方法的基础上,排除了水温不适宜等可能影响鱼类正常生存的因素的干扰;采用自动控制原理,通过多种比例试样混合的综合评价,可分别计算每个试样的TU值,将所有监测的TU值平均数作为最终TU值,使得检测结果更准确;采用在线性轨迹跟踪分析成像技术,如监测过程中鱼类轨迹突然发生异常变化,则自动触发报警装置,提醒工作人员迅速赶往现场进行应急处理,此举有效降低了人员长时间现场关注的工作量。

    一种水体环境DNA智能采集装置

    公开(公告)号:CN209400274U

    公开(公告)日:2019-09-17

    申请号:CN201822239670.5

    申请日:2018-12-28

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本实用新型公开了一种水体环境DNA智能采集装置,属于环境DNA检测技术领域。本实用新型所提供的水体环境DNA智能采集装置,集智能控制、样品采集、残夜排空以及管路堵塞泄压保护功能于一体,既能进行水体生物样品的采集,又能进行水样采集,能有效的提高生物样品采样过程效率,滤水量计算准确性,保证了样品的时效性,使得检测水样的环境更接近自然环境;具有不易堵塞、结构简单、设计合理、易于制造的优点。(ESM)同样的发明创造已同日申请发明专利

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