一种基于多阶段协同得分构建基因调控网络方法及其应用

    公开(公告)号:CN119580845A

    公开(公告)日:2025-03-07

    申请号:CN202411618313.3

    申请日:2024-11-13

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明涉及生物信息学技术领域,特别是一种基于多阶段协同得分构建基因调控网络方法及其应用,包括:首先,构建多个时间点的RNA测序文库并进行数据处理,以获取各基因在不同时间点的表达量。接着,对每一对基因的表达量进行对数转换,并计算其皮尔逊相关系数,以量化基因间的线性关系。同时,评估相邻时间点的表达变化,计算变化幅度的相似性,最终得到综合得分。通过对这些得分进行平均计算,获得该基因对的多阶段表达协同得分。基于上述得分构建基因调控网络。本发明有效反映了生物体内的复杂性和功能性,为基因调控网络的研究提供了创新思路,特别是在植物应对环境胁迫机制的研究中具有广泛应用潜力。

    一种SsRMT4基因在调控植物抗旱性中的应用

    公开(公告)号:CN115772536B

    公开(公告)日:2023-07-21

    申请号:CN202210798677.9

    申请日:2022-07-06

    Applicant: 南通大学

    Inventor: 王凯 韩苗苗 张会

    Abstract: 本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种SsRMT4基因在调控植物抗旱性中的应用,SsRMT4基因发现于具有较强抗旱特性的甘蔗割手密种材料,SsRMT4基因序列如SEQIDNO.1所示;SsRMT4基因所编码的蛋白序列如SEQIDNO.2所示。本发明揭示SsRMT4基因的表达提升可降低植物抗旱性,从而证明该基因可直接影响植物抗旱性,显示SsRMT4基因可用于植物抗旱性调节的重要基因资源,对作物抗旱育种应用有重要应用潜力。

    一种植物组织特异启动子的鉴定方法及其应用

    公开(公告)号:CN116200523A

    公开(公告)日:2023-06-02

    申请号:CN202211651359.6

    申请日:2022-12-21

    Applicant: 南通大学

    Inventor: 王凯 余光润 张会

    Abstract: 本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种植物组织特异启动子的鉴定方法及其应用。本发明基于顺式调控元件位点呈现染色质开放的特点,通过对基因上游近基因区域的开放染色质DHS搜索,高效鉴定出基因启动子;并经大量筛选鉴定发现,当基因具备一定条件的组织特异高表达时,可有效分离出茎组织特异启动子;以甘蔗为例,这一方法高效鉴定甘蔗茎特异启动子,检出率达到60%。本发明可快速、准确鉴定组织特异启动子,有利于甘蔗及其它作物通过优异基因利用,开展优异新品种培育;同时,该方法可推广到不同作物中,具有广泛的应用潜力和商业产品开发价值。

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