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公开(公告)号：CN111197085A
公开(公告)日：2020-05-26
申请号：CN202010183758.9
申请日：2020-03-16
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/689 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及微生物组学和医学分子生物学技术领域，具体涉及与自闭症相关的肠道菌群生物标志物及其应用。本发明首次发现肠道菌群可以辅助肠道毒物的降解，减少线粒体因毒物积累带来的损伤以及由此诱发的ASD的发生。本发明提供的与ASD相关的肠道菌群生物标志物包括5条代谢通路，涉及31种酶类，利用该生物标志物进行ASD的诊断和患病风险评估具有较高的准确性、敏感性和特异性，且样本采集便捷、不会造成机体损伤、检测方便快速、可进行定期检测，及早发现肠道毒物降解能力的变化，辅助ASD的早期诊断和筛查，为指导治疗及康复方案的及时调整提供依据。
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公开(公告)号：CN110551617A
公开(公告)日：2019-12-10
申请号：CN201910827091.9
申请日：2019-09-03
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所
Abstract: 本发明涉及生命科学技术领域，尤其涉及一种用于体液细菌与细胞分离的芯片、制作方法及其使用方法；芯片包括：上板、下板以及微孔膜，下板、微孔膜以及上板由下至上依次叠放，下板设有进液通道，上板设有收集通道，进液通道与收集通道通过微孔膜连接，进液通道与收集通道具有突腔结构，收集通道设有升流台；制作方法包括：制备模具，加热，并压制封装；本发明使用方法从进液通道通入体液，从收集通道逆向通入缓冲盐溶液，细菌可以通过微孔膜而被收集，而细胞则不能通过，实现细菌和细胞两者的被动式分离，这种分离方式不会对细胞活性、生物学形状和功能产生不良影响。
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公开(公告)号：CN106191037B
公开(公告)日：2018-10-30
申请号：CN201610644131.2
申请日：2016-08-08
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所
IPC: C12N15/10 , C12Q1/6869 , C40B50/06
Abstract: 本发明涉及分子生物学技术领域，具体涉及一种ITS序列多重测序文库的构建方法。所述的构建方法包括以下步骤：(1)、扩增PCR：使用引物F1和引物R1构成引物对，PCR扩增样品中的ITS1‑ITS4序列；(2)、建库PCR：使用引物F2和引物R2构成引物对，以步骤(1)获得的PCR产物为模板，进行PCR扩增。本发明提供的构建方法中所使用的40个Index，测序反应得到的数据质量和平衡性更好，测序结果更加准确；能够实现对多达15*15*10个不同文库样品的标记；不仅能够对动物肠道、水体以及大曲等复杂性相对较低的样品类型获得高特异的扩增产物；对土壤和淤泥等高复杂性的样品类型也具有较高的特异性。
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公开(公告)号：CN106192022B
公开(公告)日：2018-07-03
申请号：CN201610645199.2
申请日：2016-08-08
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所
IPC: C40B50/06 , C12Q1/6869 , C12Q1/04
Abstract: 本发明涉及分子生物学技术领域，具体涉及一种16SrRNA多重测序文库的构建方法。所述的构建方法包括以下步骤：(1)、扩增PCR：使用引物F1和引物R1构成引物对，PCR扩增样品中的16SrRNA序列；(2)、建库PCR：使用引物F2和引物R2构成引物对，以步骤(1)获得的PCR产物为模板，进行PCR扩增。本发明提供的16SrRNA多重测序文库的构建方法获得测序文库测序反应得到的数据质量和平衡性更好，测序结果更加准确；可以实现的文库样品标记数量远大于现有技术；更加适用于土壤样品中细菌多样性的研究；大大提高了样品中细菌多样性研究的准确性。
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公开(公告)号：CN103060309A
公开(公告)日：2013-04-24
申请号：CN201210580611.9
申请日：2012-12-28
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所 , 北京大学人民医院
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了宏基因组提取方法，所述方法利用探针杂交磁珠捕获方式降低宿主宏基因组DNA样品中宿主DNA。所述方法利用宿主DNA中的重复序列Alu序列及其两端保守序列作为模板，设计单向或者双向探针，其中每条探针的5’端以生物素修饰，使用包被有链霉亲和素的磁珠捕获与探针杂交的宿主DNA，以达到减弱宏基因组中宿主DNA背景、提高测序数据有效率的目的。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN102776177A
公开(公告)日：2012-11-14
申请号：CN201110119287.6
申请日：2011-05-10
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所 , 舟山同生生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了用于扩增人、鼠和兔子单克隆抗体可变区基因的引物。所述的引物具有SEQID NO：1至SEQ ID NO：330的序列。所述的引物特别适用于高通量扩增抗原特异的单B细胞抗体。
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公开(公告)号：CN102707078A
公开(公告)日：2012-10-03
申请号：CN201210165385.8
申请日：2012-05-24
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所 , 中国科学院半导体研究所
IPC: G01N35/00
Abstract: 本发明公开了一种用于DNA测序仪的试剂供应系统，包括预备管道、缓冲管道和主管道；预备管道、缓冲管道与主管道通过三通连接器连接；第一多通换向阀和第二多通换向阀；用于抽取测序反应试剂的第一蠕动泵和用于抽取缓冲液的第二蠕动泵；第一多通换向阀的进口分别与试剂瓶连通，出口通过第一蠕动泵与预备管道连接；第二蠕动泵的出口与缓冲管道连接；第二多通换向阀的进口与主管道连接，第二多通换向阀的出口分别与反应仓的进液口及废液桶连通。本发明还公开了该试剂供应系统的控制方法。本发明可以为多个反应仓及时准确地供应试剂和缓冲液，实现了多个反应同时进行，能同时对多个样本进行测序，大大提高了DNA测序效率。
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公开(公告)号：CN102703314A
公开(公告)日：2012-10-03
申请号：CN201210164838.5
申请日：2012-05-24
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所 , 中国科学院半导体研究所
Abstract: 本发明公开了一种用于DNA测序仪的控制系统，包括PLC，与PLC电连接并第一、第二伺服电机的控制器；分别与所述PLC电连接并接收所述PLC的控制信号的第一、二蠕动泵和第一、第二多通换向阀的驱动电机；CCD相机与PLC电连接并接收所述PLC的控制信号，多个传感器分别与所述PLC电连接并向所述PLC发送CCD相机的位置信号。本发明的控制系统使具有多个反应仓的DNA测序仪的试剂供应组件为多个反应仓及时准确地供应试剂和缓冲液，并能使CCD相机适时地读取每个反应仓内的光信号，实现了多个反应同时进行，从而能同时对多个样本进行测序，大大提高了DNA测序效率。
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公开(公告)号：CN102703311A
公开(公告)日：2012-10-03
申请号：CN201210165398.5
申请日：2012-05-24
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所 , 中国科学院半导体研究所
IPC: C12M1/34
Abstract: 本发明公开了一种用于DNA测序仪的自适应调整的反应仓，包括底座、进行测序反应的反应池体和用于安装测序芯片的测序芯片安装座；测序芯片安装座固定连接在反应池体上，底座上固定连接有多个导向杆，反应池体上设有与导向杆对应的多个通孔，反应池体通过通孔滑动连接在导向杆上；反应池体与底座之间设有弹性部件。本发明的用于DNA测序仪的自适应调整的反应仓，可以使光纤面板的外端面与测序芯片尽量靠近，由于反应池体与导向杆之间留有间隙，并能使光纤面板的外端面与测序芯片之间具有尽量高的平行度精度、防止了外来的光学污染，从而降低了背景噪声，实现高信噪比测序信号的获取。
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公开(公告)号：CN112501267A
公开(公告)日：2021-03-16
申请号：CN202011289612.9
申请日：2020-11-17
Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 一种RNA外切酶‑纳米孔复合体及其制备方法和应用。该应用为RNA的测序方法，包括以下步骤：采用RNA外切酶‑纳米孔复合体，先利用RNA外切酶将测序样品从一端开始，依次切下单个核苷酸并通过纳米孔，再利用核苷酸通过纳米孔的特征，进行基础核苷酸和修饰核苷酸判定；如判定结果为基础核苷酸，则记录其AUCG的种类及顺序；如判定结果为修饰核苷酸，则记录其位置，并通过其他谱学特征检测其化学修饰的种类；通过上述过程，得到测序样品的核苷酸及其化学修饰的序列信息，实现RNA序列的直读。RNA外切酶‑纳米孔复合体包括：纳米孔结构；固定在纳米孔结构内的RNA外切酶。该RNA外切酶‑纳米孔复合体能够用于RNA直测，测序速度快且能够保障各种修饰核苷酸都能够被测定。
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